Integrating haplotypes and single genetic variability effects of the<i>Pax7</i>gene on growth traits in two cattle breeds
Notice bibliographique
Résumé
The paired box 7 (Pax7) gene encoding for the transcription factor can regulate the conversion of stem cells into myogenic cells and participate in the development and regeneration of skeletal muscle. The aims of this study were to detect variations of the Pax7 gene by DNA pool sequencing and aCRS-RFLP methods in 1441 cattle from five breeds and to investigate their associations with growth traits in Nanyang and Chinese red steppe cattle. Altogether, three novel single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified in the last intron of the Pax7 gene: NC_007300: ss1 (g. G103688A), ss2 (g. T103735C), and ss3 (g. A103764T). Genotypes and the referring haplotype frequencies showed a high similarity trend among five breeds, and the G, T, and A allele frequencies of the three loci were always superior when separate or in combination. Association analysis of the single SNPs and haplotype combinations revealed that the T allele of ss2 and ss3 loci and the haplotype H(2)H(2) (GG-TT-TT) showed significant effects on growth traits such as body height, body mass, and chest girth in cattle at early stages (6 and 12 months old) (P < 0.05). The results showed that Pax7 gene variations and their corresponding genotypes may be considered as molecular markers for economic traits in cattle breeding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».