MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2323761746 · doi:10.1158/1538-7445.am10-913

Abstract 913: 5,10-Methylenetetrahydrofolate reductase C677T allele frequency and childhood leukemia incidence in predominantly European ancestry countries

2010· article· en· W2323761746 sur OpenAlexaboutno aff
Kimberly Johnson, Logan G. Spector

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethylenetetrahydrofolate reductaseLeukemiaIncidence (geometry)Poisson regressionMedicineAlleleAllele frequencyRate ratioChildhood leukemiaDemographyGeneticsMinor allele frequencyInternal medicineOncologyConfidence intervalBiologyPopulationLymphoblastic LeukemiaEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract 5,10-Methylentetrahydrofolate reductase (MTHFR) single nucleotide polymorphisms (SNPs) have been intensely studied as cancer susceptibility alleles. For childhood leukemia, data have indicated that the most commonly studied MTHFR SNP, C677T, is associated with a slightly reduced risk of acute lymphoblastic leukemia (ALL). Both childhood leukemia incidence and MTHFR allele frequencies show variation worldwide. Our objective was to conduct an ecologic study to determine whether the MTHFR C677T allele frequency and childhood leukemia incidence are associated. We used cancer incidence data collected by the International Agency for Cancer Research from 22 registries that captured 19,025 leukemia cases diagnosed between the ages of 0 and 14 years from the United States, Canada, Australia, and 18 European countries; data were restricted to registries with majority European ancestry populations in order to minimize confounding by ancestry. MTHFR allele frequencies were gathered from the literature to match as closely as possible the registry populations. We modeled the association between childhood leukemia incidence and MTHFR C677T allele frequency using Poisson regression to calculate rate ratios (RRs) and 95% confidence intervals (CIs). Estimates of the minor C677T allele frequency ranged from 24% in Finland to 44% in Italy. There was a weak inverse correlation between leukemia incidence and MTHFR C677T allele frequency (r=0.19), that was stronger for ALL (r=0.30). Acute nonlymphoblastic leukemia (ANLL) incidence was positively correlated with MTHFR C677T allele frequency (r=0.36). Poisson regression results from linear models showed that the incidence of childhood leukemia decreased by 5% (95% CI 3%-6%) for every 5% increase in the C677T allele frequency. A similar pattern was observed for ALL with a RR of 0.93 (95% CI=0.92-0.95) but not acute non-lymphoblastic leukemia (ANLL) (RR=1.04, 95% CI=1.00-1.07). The significant inverse associations between the C677T allele frequency and leukemia and ALL incidence were specific to incidence rates for children diagnosed <10 years. These results are consistent with the results of case-control studies of the association between childhood leukemia and MTHFR allele frequency suggesting a modest risk reduction in association with the C677T allele. The strengths and limitations of ecological vs. case control study designs will be discussed in the context of these results to provide insight into the causal relationship between the MTHFR minor allele frequency and childhood leukemia risk. This research was supported by NIH grant T32 CA099936. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 913.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,344 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetFolate and B Vitamins Research→Travaux en français237 207→