MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2324336716 · doi:10.1136/sextrans-2011-050119.16

LBP-1.10 Misclassification of syphilis cases using a reactive enzyme immunoassay and reactive RPR algorithm alone for diagnosis

2011· article· en· W2324336716 sur OpenAlexaffabout
Ameeta E. Singh, K Fonseca, Shamir Mukhi, Jennifer Gratrix, Sabrina S. Plitt, Ron Read, K Sutherland, George Zahariadis, Gregory J. Tyrrell, B Lee

Notice bibliographique

RevueSexually Transmitted Infections · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSyphilis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of AlbertaPublic Health Agency of CanadaProvincial Laboratory of Public HealthAlberta Health Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHandwritingMedicineAudiologyVisual feedbackArtificial intelligenceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Recent recommendations propose that samples dually reactive by a syphilis enzyme immunoassay (sEIA) and RPR be reported as positive for syphilis without confirmatory testing. Methods Samples from 1 September 2007 to 19 March 2011 testing reactive by sEIA and tested by INNO-LIA (IL) were extracted from the Alberta Provincial Laboratory for Public Health's DIAL (Data Integration for Alberta Laboratories), a web based application. Syphilis testing history was reviewed for all patients with a reactive sEIA and reactive RPR and negative (NEG) or indeterminate (IND) result by IL. Syphilis infection was defined by a positive confirmatory test (majority IL; a few TPPA and FTA-ABS). The significance of RPR titres in patients NEG/IND by IL with or without evidence of syphilis infection was analysed using χ2test. Median standard cut-offs (s/co) for the sEIA were compared using the Mann–Whitney U test. Results 6195 samples from 4695 patients with reactive sEIA were also tested by IL: 15 samples (0.2%) had no reported RPR result, 4232 (48.3%) were non-reactive by RPR, and 1948 (31.4%) samples from 1753 patients were reactive by RPR. 72 (4.1%) of the 1753 patients with reactive RPR had at least one specimen tested NEG/IND by IL (Abstract LBP-1.10 figure 1). 3 of the 72 patients (4.2%) had a serological history of syphilis infection not recognised initially, 15 (20.8%) had no follow-up testing, 23 (31.9%) had a subsequent positive IL, and 31 (43.1%) did not demonstrate syphilis infection on follow-up testing. For the 31 patients with no serological evidence of syphilis infection, 24 remained NEG/IND by IL and seven tested negative by sEIA on follow-up. Overall, 31 patients (1.7%) would have been misclassified as infected based upon an algorithm of dually reactive sEIA and RPR without confirmatory testing. 14.7% of samples that tested negative or IND for IL in confirmed syphilis had RPR titres =1:8 as compared to 20.0% of samples from patients without syphilis on follow-up serology (p=0.5). The median s/co of the screening sEIA for samples from the patients who were infected (4.8, range: 1.0–24.20) differed from the s/co (2.6, range: 1.0–12.4) for those uninfected (p<0.05). Conclusions In our experience, 1.7% (31 patients) would have been misclassified as a case of syphilis if a third confirmatory test for syphilis had not been conducted. Additional evaluation of syphilis testing algorithms is warranted before a two test algorithm is widely employed. Abstract LBP-1.10 Figure 1 Misclassification syphilis cases

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueSexually Transmitted InfectionsMême sujetSyphilis Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207