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Enregistrement W2324445651 · doi:10.1097/pai.0000000000000136

HER2 Genetic Heterogeneity in Gastric Cancer

2015· article· en· W2324445651 sur OpenAlexaff
Ann Treacy, Jason Karamchandani, Catherine Streutker, Andrea Grin

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancerImmunohistochemistryInternal medicineMedicinePathologyBreast cancerStomachEpitheliumGastroenterologyBiologyOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gastric and gastroesophageal junction (GEJ) adenocarcinomas have been shown to display significant HER2 genetic heterogeneity (GH). This is typically seen as a cluster of HER2-positive cells but can also take the form of intermingled cells, referred to a "mosaic" pattern. GH is not well defined in gastric/GEJ tumors and the "mosaic" pattern has never been studied. We sought to evaluate the frequency and distribution of the "mosaic" pattern of GH in gastric/GEJ tumors using the College of American Pathologists-endorsed breast criteria of 5% to <50% amplified nuclei. We also postulated that the lower limit of this GH definition might be seen by chance in normal gastric epithelium. A total of 360 consecutive gastric/GEJ tumors were tested for HER2 by immunohistochemistry and in situ hybridization. Individual tumor cell HER2:CEP17 ratios were calculated for each case and the percentage of tumor cells with a ratio ≥2.0 determined. In addition, 300 normal gastric epithelial cells were scored for HER2 and CEP17 signals. Overall, 265 cases (73.4%) showed GH. The percentage of amplified cells in GH cases linearly correlated with the overall HER2:CEP17 ratio. In normal gastric epithelium, a cell with an "amplified" 2:1 ratio was seen in 9.7% (29/300) of cells, thus reaching GH. The chance of "GH" in scoring 20 normal epithelial cells was 87%. We conclude that GH is very common in gastric/GEJ tumors when College of American Pathologists breast criteria are applied and the lower threshold is likely of little clinical significance due to the finding "amplified" 2:1 nuclei in normal cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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