HER2 Genetic Heterogeneity in Gastric Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Gastric and gastroesophageal junction (GEJ) adenocarcinomas have been shown to display significant HER2 genetic heterogeneity (GH). This is typically seen as a cluster of HER2-positive cells but can also take the form of intermingled cells, referred to a "mosaic" pattern. GH is not well defined in gastric/GEJ tumors and the "mosaic" pattern has never been studied. We sought to evaluate the frequency and distribution of the "mosaic" pattern of GH in gastric/GEJ tumors using the College of American Pathologists-endorsed breast criteria of 5% to <50% amplified nuclei. We also postulated that the lower limit of this GH definition might be seen by chance in normal gastric epithelium. A total of 360 consecutive gastric/GEJ tumors were tested for HER2 by immunohistochemistry and in situ hybridization. Individual tumor cell HER2:CEP17 ratios were calculated for each case and the percentage of tumor cells with a ratio ≥2.0 determined. In addition, 300 normal gastric epithelial cells were scored for HER2 and CEP17 signals. Overall, 265 cases (73.4%) showed GH. The percentage of amplified cells in GH cases linearly correlated with the overall HER2:CEP17 ratio. In normal gastric epithelium, a cell with an "amplified" 2:1 ratio was seen in 9.7% (29/300) of cells, thus reaching GH. The chance of "GH" in scoring 20 normal epithelial cells was 87%. We conclude that GH is very common in gastric/GEJ tumors when College of American Pathologists breast criteria are applied and the lower threshold is likely of little clinical significance due to the finding "amplified" 2:1 nuclei in normal cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».