The M184V mutation in HIV-1 reverse transcriptase reduces the restoration of wild-type replication by attenuated viruses
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To study the ability of HIV constructs containing the M184V substitution in reverse transcriptase (RT), which causes resistance to lamivudine, to evolve mutations that compensate for deletions within the HIV genome. METHODS: Viruses containing deletions in non-coding regions of the viral genome were examined in tissue culture to see whether the additional presence of M184V delays the reestablishment of wild-type replication kinetics. Potential compensatory mutations were identified by sequencing, and site-directed mutagenesis was carried out to confirm the biological relevance of such substitutions. The rate of initiation of reverse transcription was measured using either recombinant wild-type RT or RT containing M184V. RESULTS: M184V-containing viruses were unable to undergo compensatory mutagenesis to reestablish wild-type replication kinetics, whereas viruses that did not contain M184V were able to mutate extensively. This ability was demonstrated most extensively in viruses deleted of an "A-rich loop", located upstream of the primer-binding site, which is involved in initiation of reverse transcription. The rate of such initiation was severely diminished in virus containing the RT enzyme carrying the M184V substitution. This inhibitory effect was significantly enhanced in a biochemical system that included both the M184V mutant enzyme and a viral DNA template that contained the deletion in the A-rich loop. CONCLUSIONS: These findings provide further biological and biochemical evidence that M184V-containing viruses are impaired in replication fitness. Viruses that had the A-rich-loop deleted were able to reestablish replication ability quickly in the wild-type RT, which provides further evidence for the plasticity of the HIV genome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».