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Enregistrement W2324731084 · doi:10.1158/1538-7445.am2012-4131

Abstract 4131: Serum miRNA profiles of patients with oral cancer and pre-cancer

2012· article· en· W2324731084 sur OpenAlexaff
Sara A. MacLellan, James Lawson, Jonathan Baik, Martial Guillaud, Catherine F. Poh, Cathie Garnis

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésmicroRNACancerMedicineInternal medicineOncologyCarcinomaBasal cellStage (stratigraphy)GastroenterologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Oral cancer is one of the most commonly diagnosed cancers worldwide. Those diagnosed with this disease are often diagnosed at late stage with poor 5-year survival rate and/or suffer from a high rate of local recurrence or second primary tumor. Novel approaches for early detection for treatment stratification are needed to improve these statistics. MicroRNAs (miRNAs), a group of small, non-coding RNAs, can be isolated from blood serum samples and have shown the potential to be used as a non-invasive detection method in several cancer types. The purpose of this study is to examine the expression profiles of circulating miRNAs in the serum of patients with high-risk oral lesions (HRLs; oral cancer/carcinoma in situ) and to explore their utility as potential oral cancer biomarkers. Methods: Serum samples were collected from 33 patients with HRL (17 oral cancer and 16 carcinoma in situ) undergoing intent-to-cure surgical treatment and from a demographically matched (for age, sex, and smoking status) normal control group (N=15). RNA was extracted from serum samples using a modified miRNeasy (Qiagen) protocol. The miRCURY LNA™ Universal RT miRNA PCR system was used to profile all serum samples. The system allowed for the profiling of 742 miRNAs plus required controls within a single experiment. Statistical tests were carried out using Statistica 64 and Microsoft Excel. Results: Using analysis of variance, we detected 37 miRNAs that showed a significant differential expression between the three groups (oral squamous cell carcinoma, carcinoma in situ, and controls). Among these 37 miRNAs, miR-223, miR-342-3p, miR-423-5p, and miR-451 were the most differentially expressed. Conclusions: By examining circulating miRNA expression profiles, we have identified potential biomarkers that can be obtained from a simple blood test. The differential expression of serum miRNAs between disease stages suggests the possible utility of these miRNAs as biomarkers for the early detection of oral cancer and its progression. Blood samples are easily collected from patients, and combining serum miRNA profiles with other screening techniques could greatly improve the sensitivity in oral cancer detection. Early detection to facilitate treatment decision making for those with oral cancer or premalignant disease would have a great impact on disease survival. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 4131. doi:1538-7445.AM2012-4131

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
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