MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2324877861 · doi:10.1042/bst20130282

Tapping the translation potential of cAMP signalling: molecular basis for selectivity in cAMP agonism and antagonism as revealed by NMR

2014· review· en· W2324877861 sur OpenAlexafffund
Stephen Boulton, Madoka Akimoto, Bryan VanSchouwen, Kody Moleschi, Rajeevan Selvaratnam, Rajanish Giri, Giuseppe Melacini

Notice bibliographique

RevueBiochemical Society Transactions · 2014
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAllosteric regulationEffectorAffinitiesChemistryGuanine nucleotide exchange factorGatingPhosphorylationCell biologyProtein kinase AG proteinBiochemistrySignal transductionBiologyReceptorBiophysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eukaryotic CBDs (cAMP-binding domains) control multiple cellular functions (e.g. phosphorylation, guanine exchange and ion channel gating). Hence the manipulation of cAMP-dependent signalling pathways has a high translational potential. However, the ubiquity of eukaryotic CBDs also poses a challenge in terms of selectivity. Before the full translational potential of cAMP signalling can be tapped, it is critical to understand the structural basis for selective cAMP agonism and antagonism. Recent NMR investigations have shown that structurally homologous CBDs respond differently to several CBD ligands and that these unexpected differences arise at the level of either binding (i.e. affinity) or allostery (i.e. modulation of the autoinhibitory equilibria). In the present article, we specifically address how the highly conserved CBD fold binds cAMP with markedly different affinities in PKA (protein kinase A) relative to other eukaryotic cAMP receptors, such as Epac (exchange protein directly activated by cAMP) and HCN (hyperpolarization-activated cyclic-nucleotide-modulated channel). A major emerging determinant of cAMP affinity is hypothesized to be the position of the autoinhibitory equilibrium of the apo-CBD, which appears to vary significantly across different CBDs. These analyses may assist the development of selective CBD effectors that serve as potential drug leads for the treatment of cardiovascular diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,493
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemical Society TransactionsMême sujetProtein Kinase Regulation and GTPase SignalingTravaux en français237 207