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Enregistrement W2324898736 · doi:10.1530/erc-14-0423

The UGT1 locus is a determinant of prostate cancer recurrence after prostatectomy

2014· article· en· W2324898736 sur OpenAlexafffund
Isabelle Laverdière, Christine Flageole, Étienne Audet‐Walsh, Patrick Caron, Yves Fradet, Louis Lacombe, Éric Lévesque, Chantal Guillemette

Notice bibliographique

RevueEndocrine Related Cancer · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier de l'Université LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesProstate Cancer CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismProstate cancerInternal medicineHaplotypeProportional hazards modelLocus (genetics)Hazard ratioMedicineOncologyEndocrinologyBiochemical recurrenceAlleleGlucuronosyltransferaseProstatectomyGenotypeGeneticsBiologyCancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The prognostic significance of common deletions in uridine diphospho-glucuronosyltransferase 2B (UGT2B) genes encoding sex steroid metabolic enzymes has been recently recognized in localized prostate cancer (PCa) after radical prostatectomy (RP). However, the role of germline variations at the UGT1 locus, encoding half of all human UGTs and primarily involved in estrogen metabolism, remains unexplored. We investigated whether variants of UGT1 are potential prognostic markers. We studied 526 Caucasian men who underwent RP for clinically localized PCa. Genotypes of patients for 34 haplotype-tagged single-nucleotide polymorphisms (htSNPs) and 11 additional SNPs across the UGT1 locus previously reported to mark common variants including functional polymorphisms were determined. The risk of biochemical recurrence (BCR) was estimated using adjusted Cox proportional hazards regression and Kaplan-Meier analysis. We further investigated whether variants are associated with plasma hormone levels by mass spectrometry. In multivariable models, seven htSNPs were found to be significantly associated with BCR. A greater risk was revealed for four UGT1 intronic variants with hazard ratios (HRs) of 1.59-1.88 (P<0.002) for htSNPs in UGT1A10, UGT1A9, and UGT1A6. Conversely, decreased BCR was associated with three htSNPs in introns of UGT1A10 and UGT1A9 (HR=0.56-058; P≤0.01). An unfavorable UGT1 haplotype comprising all risk alleles, with a frequency of 14%, had a HR of 1.68 (95% CI=1.13-2.50; P=0.011). Significant alteration in circulating androsterone levels was associated with this haplotype, consistent with changes in hormonal exposure. This study provides the first evidence, to our knowledge, that germline polymorphisms of UGT1 are potential predictors of recurrence of PCa after prostatectomy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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