The UGT1 locus is a determinant of prostate cancer recurrence after prostatectomy
Notice bibliographique
Résumé
The prognostic significance of common deletions in uridine diphospho-glucuronosyltransferase 2B (UGT2B) genes encoding sex steroid metabolic enzymes has been recently recognized in localized prostate cancer (PCa) after radical prostatectomy (RP). However, the role of germline variations at the UGT1 locus, encoding half of all human UGTs and primarily involved in estrogen metabolism, remains unexplored. We investigated whether variants of UGT1 are potential prognostic markers. We studied 526 Caucasian men who underwent RP for clinically localized PCa. Genotypes of patients for 34 haplotype-tagged single-nucleotide polymorphisms (htSNPs) and 11 additional SNPs across the UGT1 locus previously reported to mark common variants including functional polymorphisms were determined. The risk of biochemical recurrence (BCR) was estimated using adjusted Cox proportional hazards regression and Kaplan-Meier analysis. We further investigated whether variants are associated with plasma hormone levels by mass spectrometry. In multivariable models, seven htSNPs were found to be significantly associated with BCR. A greater risk was revealed for four UGT1 intronic variants with hazard ratios (HRs) of 1.59-1.88 (P<0.002) for htSNPs in UGT1A10, UGT1A9, and UGT1A6. Conversely, decreased BCR was associated with three htSNPs in introns of UGT1A10 and UGT1A9 (HR=0.56-058; P≤0.01). An unfavorable UGT1 haplotype comprising all risk alleles, with a frequency of 14%, had a HR of 1.68 (95% CI=1.13-2.50; P=0.011). Significant alteration in circulating androsterone levels was associated with this haplotype, consistent with changes in hormonal exposure. This study provides the first evidence, to our knowledge, that germline polymorphisms of UGT1 are potential predictors of recurrence of PCa after prostatectomy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».