A Dual Photochemical Ring-Opening/Cleavage Approach for the Synthesis and Decoding of One-Bead-One-Compound Cyclic Peptide Libraries
Notice bibliographique
Résumé
With a great therapeutic potential, peptide macrocycles have gained a lot of interest in drug discovery. Compared to their linear counterparts, cyclic peptides show improved resistance to proteases and their increased conformational rigidity lowers the entropic cost of binding, making them tighter-binding to a given macromolecule [1,2]. The great degree of molecular diversity and complexity that can be accessed by simple changes in their sequence has prompted the use of cyclic peptides in combinatorial chemistry. The one-bead-one-compound (OBOC) approach, in which each bead carries many copies of a unique compound, has become a powerful tool in the drug discovery process [3]. However, the use of cyclic peptides in combinatorial OBOC libraries has been limited by difficulties in sequencing hit compounds after the screening. Lacking a free N-terminal amine, Edman degradation sequencing cannot be used on cyclic peptides and complicated fragmentation patterns are obtained by tandem mass spectrometry (MS/MS). This problem has been initially overcome by using a bead topological segregation strategy [4,5]. More recently, different strategies have been reported to avoid encoding by using a ring-opening approachto allow a simultaneous linearization and compound release from the bead [6-9]. Most of the reported methods require post-screening chemical reactions that could lead to side chain modification. Based on these strategies, we were looking for an efficient, single step and chemical reagent free ring-opening approach that would be compatible with free amino acid side chains.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».