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Enregistrement W2325173906 · doi:10.1021/ac2025943

On-Chip Transduction of Nucleic Acid Hybridization Using Spatial Profiles of Immobilized Quantum Dots and Fluorescence Resonance Energy Transfer

2011· article· en· W2325173906 sur OpenAlexafffund
Anthony J. Tavares, M. Omair Noor, Charles H. Vannoy, W. Russ Algar, Ulrich J. Krull

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiosensors and Analytical Detection
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto Mississauga
Mots-clésFörster resonance energy transferChemistryNucleic acidQuantum dotOligonucleotideFluorescenceMicrofluidicsElectrokinetic phenomenaNucleic acid thermodynamicsAnalytical Chemistry (journal)DNANanotechnologyChromatographyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The glass surface of a glass-polydimethylsiloxane (PDMS) microfluidic channel was modified to develop a solid-phase assay for quantitative determination of nucleic acids. Electroosmotic flow (EOF) within channels was used to deliver and immobilize semiconductor quantum dots (QDs), and electrophoresis was used to decorate the QDs with oligonucleotide probe sequences. These processes took only minutes to complete. The QDs served as energy donors in fluorescence resonance energy transfer (FRET) for transduction of nucleic acid hybridization. Electrokinetic injection of fluorescent dye (Cy3) labeled oligonucleotide target into a microfluidic channel and subsequent hybridization (within minutes) provided the proximity for FRET, with emission from Cy3 being the analytical signal. The quantification of target concentration was achieved by measurement of the spatial length of coverage by target along a channel. Detection of femtomole quantities of target was possible with a dynamic range spanning an order of magnitude. The assay provided excellent resistance to nonspecific interactions of DNA. Further selectivity of the assay was achieved using 20% formamide, which allowed discrimination between a fully complementary target and a 3 base pair mismatch target at a contrast ratio of 4:1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,265
Score d'incertitude au seuil0,497

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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