MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2325316722 · doi:10.1055/s-0032-1320536

Investigating the anti-tubercular mechanism of action of pseudopteroxazole: An activity-based photolabeling approach

2012· article· en· W2325316722 sur OpenAlexaff
DH Marchbank, MWB McCulloch, Bradley Haltli, DP Overy, R B Kerr

Notice bibliographique

RevuePlanta Medica · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMechanism of actionMycobacterium tuberculosisMode of actionPhotoaffinity labelingTuberculosisBedaquilineDrugMechanism (biology)PopulationPharmacologyChemistryBiologyComputational biologyMedicineBiochemistryBinding siteIn vitroPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycobacterium tuberculosis (MTB), the etiologic agent of tuberculosis disease, causes nearly two million deaths annually and has established a latent infection in one third of the human population. 1 Pseudopteroxazole (Ptx), a diterpene isolated from the coral Pseudopterogorgia elisabethae , 2 exhibits promising activity in a model of non-replicating persistent MTB and against several drug-resistant MTB strains. 3,4 Considering the structural novelty of Ptx, as well as its efficacy against drug-resistant MTB strains, we hypothesize that Ptx may exert its activity through a unique mechanism of action (MoA). The aim of this research is to identify the MoA of Ptx by pursuing two complementary strategies. The mode of action of Ptx will be determined by measuring the incorporation of tritiated precursors into bacterial macromolecules. Meanwhile, the cellular target of Ptx will be identified using an activity-based photolabeling strategy by employing semisynthetic photoaffinity probes. 1) Barry, C.E.; et al. Nat. Rev. Microbiol. 2009 , 7 , 845. 2) Rodríguez, A.D.; et al. Org. Lett. 1999 , 1 , 527. 3) McCulloch, M.W.B.; et al., J. Nat. Prod. 2011 , 74 , 2250. 4) McCulloch, M.W.B.; Haltli, B.; Marchbank, D.H.; Kerr, R.G. Mar. Drugs 2012 [submitted].

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePlanta MedicaMême sujetMarine Sponges and Natural ProductsTravaux en français237 207