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Enregistrement W2325322861 · doi:10.1242/jeb.098731

Tight junction protein gene expression patterns and changes in transcript abundance during development of model fish gill epithelia

2014· article· en· W2325322861 sur OpenAlexafffund
Dennis Kolosov, Helen Chasiotis, Scott P. Kelly

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésFish <Actinopterygii>BiologyAbundance (ecology)Gene expressionGeneMessenger RNAProtein expressionCell biologyZoologyFisheryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In vertebrates, tight junction (TJ) proteins play an important role in epithelium formation and development, the maintenance of tissue integrity and regulation of TJ permeability. In this study, primary cultured model gill epithelia composed of pavement cells (PVCs) were used to examine TJ protein transcript abundance during the development of epithelium confluence and epithelium resistive properties. Differences in TJ protein expression patterns and transcript abundance between gill models composed of PVCs and models composed of PVCs and mitochondrion-rich cells (MRCs) were also examined. Marked alterations in TJ protein transcript abundance were observed as cells developed to confluence in flask-cultured model gill epithelia. In contrast, during the formation of tissue resistance in insert-cultured epithelia (i.e. epithelia cultured on a permeable substrate), changes in TJ protein mRNA abundance were conservative, despite paracellular marker flux decreasing by orders of magnitude. In both cases significant changes in claudin-8b, -8d, -27b, -28b and -32a transcript abundance were observed, suggesting that temporal alterations in the abundance of these genes are important end points of model gill epithelium integrity. When MRCs were present in cultured gill models, the mRNA abundance of several TJ proteins significantly altered and claudin-10c, -10d and -33b were only detected in preparations that included MRCs. These data provide insight into the role of select TJ proteins in the formation and development of gill epithelia and the maintenance of gill barrier properties. In addition, observations reveal a heterogeneous distribution of claudin TJ proteins in the gill epithelial cells of rainbow trout.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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