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Enregistrement W2325415461 · doi:10.1021/ac403171u

Multisegment Injection-Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry: A High-Throughput Platform for Metabolomics with High Data Fidelity

2013· article· en· W2325415461 sur OpenAlexafffund
Naomi L. Kuehnbaum, Aleshia Kormendi, Philip Britz‐McKibbin

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Genomics InstituteOntario Genomics
Mots-clésChemistryMetabolomicsMass spectrometryCapillary electrophoresisThroughputChromatographyReproducibilitySample (material)Resolution (logic)Analytical Chemistry (journal)Capillary electrophoresis–mass spectrometryElectrospray ionizationComputer scienceArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A major constraint in large-scale mass spectrometry (MS)-based metabolomic initiatives is the low sample throughput associated with chromatographic or electrophoretic separations. Herein, we introduce multisegment injection-capillary electrophoresis-mass spectrometry (MSI-CE-MS) as a multiplexed separation platform for metabolomics that increases sample throughput up to one order of magnitude while improving overall data fidelity. We demonstrate that serial injection of seven or more discrete sample segments can be performed within a single capillary while maintaining isomeric resolution without ion suppression when using a high mass resolution time-of-flight-MS. Customized injection sequences can be devised to encode information temporally within a separation based on signal pattern recognition, which enables unambiguous identification and accurate quantification (mean bias <10%) of polar metabolites in human plasma with good reproducibility (CV ≈ 10%, n = 70). False discoveries are avoided when using a rigorous dilution trend filter to reject spurious signals and background peaks that comprise the majority (≈65%) of total detectable features. MSI-CE-MS offers an unprecedented approach to enhance sample throughput analogous to direct infusion-MS (≈3 min/sample) while delivering far greater selectivity, quantitative performance, and data quality since the same ion from different samples migrates into the ion source within a short time interval (≈2-6 min). These distinct analytical and bioinformatic merits are achieved without column switching, isotopic labeling, hardware modifications, or costly infrastructure investments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations139
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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