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Enregistrement W2325488581 · doi:10.1055/s-2006-943573

NOVEL LOCALIZATION OF OCTN1, AN ORGANIC CATION/CARNITINE TRANSPORTER, TO MAMMALIAN MITOCHONDRIA: IMPLICATIONS FOR CARNITINE-RESPONSIVE ENCEPHALOPATHY AND MYOPATHY

2006· article· en· W2325488581 sur OpenAlexaff
A.M. Lamhonwah, Ingrid Tein

Notice bibliographique

RevueNeuropediatrics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarnitineTransporterMitochondrionZwitterionMedicineEncephalopathyOrganic cation transport proteinsMyopathyMitochondrial myopathyBiochemistryEndocrinologyInternal medicineBiologyChemistryGeneMitochondrial DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives: To determine the cellular localization of the organic cation/carnitine transporter, OCTN1. Carnitine is a zwitterion essential for the ß-oxidation of fatty acids. Methods: We made GFP- and RFP-human OCTN1 cDNA constructs and transfected them into several mammalian cell lines (e.g.HepG2, human skin fibroblasts, HEK 293, MEF-3T3). We immunostained the GFP-hOCTN1 transfected cells with different intracellular markers and then applied confocal fluorescent microscopy. We measured L-[3H]-carnitine uptake in freshly isolated mitochondria of GFP-hOCTN1 transfected HepG2. We also measured uptake in mutant human skin fibroblasts having <1% of carnitine acylcarnitine translocase (CACT) activity (alternate mitochondrial carnitine transporter). Results: Immunostaining of GFP-hOCTN1 transfected cells with different intracellular markers and confocal fluorescent microscopy analysis demonstrated mitochondrial expression of OCTN1. There was striking co-localization of an RFP-hOCTN1 fusion protein and a mitochondrial-GFP marker construct in transfected MEF-3T3 and no co-localization of GFP-hOCTN1 in transfected human skin fibroblasts with other intracellular markers. L- [3H]-carnitine uptake in freshly isolated mitochondria of GFP-hOCTN1 transfected HepG2 demonstrated a Km of 422µM and western blot with an anti-GFP antibody identified a GFP-hOCTN1 fusion protein (90kDa). We showed endogenous expression of native OCTN1 in HepG2 mitochondria with anti-GST-hOCTN1 antibody. Further, we definitively confirmed intact L-[3H]-carnitine uptake (Km 1324µM) solely attributable to OCTN1 in isolated mitochondria of mutant human skin fibroblasts having <1% of CACT activity. Conclusion: This mitochondrial localization suggests an important yet different role for OCTN1 from other OCTN family members in intracellular carnitine homeostasis. The predicted clinical phenotype for a defect in the OCTN1 transporter may parallel the myopathic and episodic hypoketotic hypoglycemic encephalopathy phenotypes of the high-affinity plasmalemmal carnitine transporter, OCTN2 and CACT defects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
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