MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2325657120 · doi:10.1139/w2012-011

Importance of the<i>icmN</i>gene in the growth of<i>Legionella pneumophila</i>in amoebic cells at low temperature

2012· article· en· W2325657120 sur OpenAlexvenueno aff
Tian Qin, Ken‐ichiro Iida, Zhenyu Piao, Susumu Shiota, Hongyu Ren, Zhujun Shao, Shin�ichi Yoshida

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLegionella and Acanthamoeba research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesState Key Laboratory of Infectious Disease Prevention and Control
Mots-clésLegionella pneumophilaOperonMutantIntracellularBiologyAmoeba (genus)MicrobiologyGeneSecretionLegionellaIntracellular parasiteCell biologyBacteriaGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Legionella pneumophila grows in amoebae and has achieved the ability to grow at various temperatures, although the mechanisms controlling this ability remain poorly understood. The Icm/Dot type IVB secretion system is composed of more than 25 proteins and is known to be essential for intracellular growth. The role of the icmN gene in intracellular multiplication and the effects of culture temperatures on it are not precisely understood. We conducted our investigation using an icmN mutant made by gene replacement mutagenesis. Intracellular growth of the mutant was impaired both in mammalian macrophages and amoeba at 37 °C. In particular, intracellular growth in amoebae was completely impaired at 25 °C. It was found that genes from icmN to icmC formed an operon, i.e., icmN, -M, -L, -E, -G, -C,, and the promoter activity of the icmN operon was stronger at 25 than at 37 °C. It was suggested that icmM and its downstream genes had a secondary promoter that enables icmN mutant grow in amoebae at lower temperatures and macrophages at 37 °C. These results show that the icmN promoter has a low temperature inducible nature, and gene products of the icmN operon require high expression for bacterial proliferation at low temperatures within amoeba.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of MicrobiologyMême sujetLegionella and Acanthamoeba researchTravaux en français237 207