MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2325874846 · doi:10.1161/circ.130.suppl_2.18705

Abstract 18705: The miR-130/301 Family Exerts Systems-level Regulation of Proliferation, Vasoconstriction, and Extracellular Matrix Deposition to Control Pulmonary Hypertension

2014· article· en· W2325874846 sur OpenAlexaff
Thomas Bertero, Katherine A. Cottrill, Yu Lu, Sofia Annis, Andrew Hale, Adrienn Krauszman, Balkrishen Bhat, Rajan Saggar, Rajeev Saggar, William D. Wallace, David J. Ross, Sara O. Vargas, Brian B. Graham, Rahul Kumar, Stephen M. Black, Sohrab Fratz, Jeffrey R. Fineman, James West, Kathleen J. Haley, Aaron B. Waxman, Wolfgang M. Kuebler, B. Nelson Chau, Stephen Y. Chan

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePulmonary Hypertension Research and Treatments
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPulmonary hypertensionMedicineExtracellular matrixVascular remodelling in the embryoInternal medicineHypoxic pulmonary vasoconstrictionEndocrinologyVasoconstrictionCell biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Pulmonary hypertension (PH) is a deadly vascular disease with enigmatic molecular origins. Facets of PH have been characterized in isolation, but many have yet to be unified by a common upstream regulator. Methods & Results: We constructed a network in silico of 247 genes and 2,274 functional interactions involved in PH. Using this model and advanced network analysis, we predicted the miR-130/301 family to have the most diverse pool of PH-relevant target genes among conserved microRNAs (miRNAs). Guided by these predictions, we found that this family was up-regulated by hypoxia, inflammatory cytokines, and factors genetically linked to PH. MiR-130/301 family members were also up-regulated in remodeled pulmonary vessels in 7 animal models and 3 human subtypes of PH. Via gain- and loss-of-function experiments in vitro , we found that miR-130/301 suppressed a cohort of PPARgamma-related targets to regulate two pro-proliferative pathways (the apelin-miR-424/503-FGF2 axis in PAECs and the STAT3-miR-204-SRC axis in PASMCs); vasomotor tone ( e.g. , endothelin-1 and endothelial nitric oxide synthase); and extracellular matrix remodeling ( e.g. , the collagen crosslinking enzyme LOX). In turn, delivery of miR-130a mimic oligonucleotides in pulmonary vessels of mice altered expression of the predicted cohort of PPARgamma-related factors, leading to increased vascular remodeling (19.62±1.36 percent muscularized arterioles for miR-130a vs. 6.98±0.55 percent for scrambled control, p<0.05, mean±SEM), pulmonary vascular resistance (791±124.5 [10 3 *dyn*s*cm -5 ] for miR-130a vs. 462±25.4 for control, p<0.05), and perivascular collagen deposition and cross-linking (9.67±1.24 percent of perivascular area positive for Picrosirius Red stain vs 1.24±0.15 percent for scrambled control, p<0.05). After PH initiation in mice (chronic hypoxia+SU5416), coordinated inhibition of these miRNAs in vivo via antisense oligonucleotides mitigated these effects. Conclusions: We used network modeling to identify miR-130/301 as a master regulator of PH and a novel potential therapeutic target. These findings provide critical support for the evolving application of network modeling to discover the hidden molecular origins of PH and other human diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCirculation→Même sujetPulmonary Hypertension Research and Treatments→Travaux en français237 207→