Using focused structural proteomics to elucidate the molecular basis of MAPK regulation in T cells
Notice bibliographique
Résumé
Comprehensive molecular insights into a specific disease most often require whole pathways and processes to be considered.Structural biology together with complementing biochemical studies is the major means for achieving detailed insight into the molecular mechanisms of proteins in such pathways: how they interact, how they are regulated, and how enzymes recognize and transform substrates.This information provides a knowledge basis for current target drug design efforts and the structural information can directly assist in the rational drug design cycle.The Structural Genomics Consortium (SGC) is an Anglo-Canadian-Swedish consortium pursuing a systematic effort at generating structural insights into proteins of disease related pathways and structural families.At the SGC-Stockholm node, "the little brother" in the consortium, some 430 proteins are currently studied within areas such as; receptor signaling (Toll-, TGF-beta-and RTK-receptor based signalling), apoptosis signaling, phosphoinositol and other lipid signaling, ATPases (RNA-helicases and AAA-ATPases), poly-ADP ribose polymerase, as well as nucleotide and amino acid metabolism.Many of the proteins targeted are implied in diseases such as; cancer, inflammatory and infectious diseases.Approximately 70 novel human structures, plus follow-up structures, have been determined in the last three years at SGC-Stockholm.The specific structural genomic strategy applied on some of the pathways and families motioned above will be discussed, as well as examples of structural insights generated by this strategy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».