MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2326098356 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-lb-101

Abstract LB-101: Y-box binding protein-1 (YB-1) inhibition triggers differentiation of normal and cancer stem cells from the brain

2011· article· en· W2326098356 sur OpenAlexaff
Abbas Fotovati, Sam Abu-Ali, Pei‐Shan Wang, Loic P. Deleyrolle, Cathy Lee, Joanna Tricott, James Chen, Sonia Franciosi, Yas Nakamura, Yasuo Sugita, Takeshi Uchiumi, Michihiko Kuwano, Blair R. Leavitt, Sheila K. Singh, Alexa Jury, Chris Jones, Hiroaki Wakimoto, Brent A. Reynolds, Catherine J. Pallen, Sandra E. Dunn

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcMaster UniversityPacific Centre for Reproductive MedicineUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeurosphereNestinNeural stem cellSubventricular zoneGene silencingCancer researchStem cellBiologyCancer stem cellCellular differentiationMolecular biologyCell biologyChemistryAdult stem cellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Y-box-binding protein-1 (YB-1) is up-regulated in many human malignancies including glioblastoma (GBM). It is also essential for normal brain development, suggesting that YB-1 is part of a neural stem cell (NSC) network. Here we show that YB-1 was highly expressed in the subventricular zone (SVZ) of mouse fetal brain tissues but not in terminally differentiated primary astrocytes. Conversely, YB-1 knock-out mice had reduced Sox-2, nestin and musashi expression in the SVZ. While primary murine neurospheres were rich in YB-1, its expression was lost during glial differentiation. Likewise, YB-1, Sox-2, mushashi, Bmi-1 and nestin are coordinately expressed in SF188 cells and 9/9 GBM patient-derived primary CSCs. Silencing YB-1 with small interfering RNA attenuated the expression of these NSC markers, reduced neurosphere growth and triggered differentiation via coordinate loss of GSK3-β. Further, differentiation of CSCs with 1% serum or bone morphogenetic protein-4 (BMP-4) suppressed YB-1 protein expression. Likewise, YB-1 expression was lost during differentiation of normal human NSCs. Consistent with these observations, YB-1 was preferentially expressed in highly undifferentiated primary gliomas based on the analysis of WHO grade 1-IV tumors (n=49 cases). YB-1 was also co-expressed with Bmi-1 (Spearmans 0.80, p>0.001) and Sox-2 (Spearmans 0.66, p>0.001) based on the analysis of 282 cases of high-grade gliomas. These CSC markers were also highly expressed in 10/15 (67%) of GBM patients that subsequently relapsed. In conclusion, YB-1 is a key feature of stem cells where it functions to suppress differentiation. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr LB-101. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-LB-101

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetRNA Research and Splicing→Travaux en français237 207→