Binding of Gd<sup>3+</sup>to the neuronal signalling protein calexcitin identifies an exchangeable Ca<sup>2+</sup>-binding site
Notice bibliographique
Résumé
Calexcitin was first identified in the marine snail Hermissenda crassicornis as a neuronal-specific protein that becomes upregulated and phosphorylated in associative learning. Calexcitin possesses four EF-hand motifs, but only the first three (EF-1 to EF-3) are involved in binding metal ions. Past work has indicated that under physiological conditions EF-1 and EF-2 bind Mg(2+) and Ca(2+), while EF-3 is likely to bind only Ca(2+). The fourth EF-hand is nonfunctional owing to a lack of key metal-binding residues. The aim of this study was to use a crystallographic approach to determine which of the three metal-binding sites of calexcitin is most readily replaced by exogenous metal ions, potentially shedding light on which of the EF-hands play a `sensory' role in neuronal calcium signalling. By co-crystallizing recombinant calexcitin with equimolar Gd(3+) in the presence of trace Ca(2+), EF-1 was shown to become fully occupied by Gd(3+) ions, while the other two sites remain fully occupied by Ca(2+). The structure of the Gd(3+)-calexcitin complex has been refined to an R factor of 21.5% and an Rfree of 30.4% at 2.2 Å resolution. These findings suggest that EF-1 of calexcitin is the Ca(2+)-binding site with the lowest selectivity for Ca(2+), and the implications of this finding for calcium sensing in neuronal signalling pathways are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».