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Enregistrement W2326644334 · doi:10.1139/g2012-031

Integrated cytogenetic, ecological, and DNA barcode study reveals cryptic diversity in<i>Simulium</i>(<i>Gomphostilbia</i>)<i>angulistylum</i>(Diptera: Simuliidae)

2012· article· en· W2326644334 sur OpenAlexvenueno aff
Pairot Pramual, Chaliow Kuvangkadilok

Notice bibliographique

RevueGenome · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFreshwater macroinvertebrate diversity and ecology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesThailand Research Fund
Mots-clésBiologyBlack flyGenetic diversityEcologyPhylogeographyDNA barcodingPopulationCytochrome c oxidase subunit IMitochondrial DNAEvolutionary biologyCytochrome bZoologyPhylogeneticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An integrated approach based on cytogenetics, molecular genetics, and ecology was used to examine diversity in the black fly Simulium angulistylum Takaoka & Davies in Thailand. Cytological analysis revealed three cytoforms (A, B, and C) of S. angulistylum differentiated by fixed chromosome inversions. Distributions of these cytoforms were associated with ecology. Cytoforms A and B were found in low-altitude habitats (<600 m above sea level), whereas cytoform C occurred at high altitudes (>1000 m above sea level). Mitochondrial DNA sequences of the cytochrome oxidase subunit I barcoding region revealed significant genetic differentiation among the cytoforms. The mitochondrial DNA haplotype network revealed divergent lineages within cytoforms, indicating additional hidden diversity. Therefore, integrated approaches are necessary for fully understanding black fly biodiversity. Population genetic analysis revealed high genetic structuring that could be due to the habitat preferences of S. angulistylum. Phylogeographic analyses indicated population demographic expansion at the mid-Pleistocene (900 000 years ago), which is older than for other black flies and insects in the Southeast Asian mainland. The high level of genetic structure and diversity, therefore, could also be due to the long demographic history of S. angulistylum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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