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Enregistrement W2326687951 · doi:10.1158/1538-7445.am2012-1185

Abstract 1185: Plakoglobin (β-catenin) interacts with the transcription factor p53 and regulates the expression of genes involved in tumorigenesis and metastasis

2012· article· en· W2326687951 sur OpenAlexaff
Zackie Aktary, Manijeh Pasdar

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlakoglobinCateninBiologyCell biologyChromatin immunoprecipitationTranscription factorCancer researchCarcinogenesisGene expressionMolecular biologySignal transductionGeneGeneticsPromoterWnt signaling pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plakoglobin (β-catenin) and β-catenin are highly homologous proteins that function in cell-cell adhesion and signaling. Both proteins exist in a cadherin-associated form, which mediates adhesion, and in a distinct cytosolic/nuclear form, which plays a signaling role. Despite their interactions with common cellular partners, β-catenin has well documented oncogenic potential while plakoglobin expression is generally associated with tumor/metastasis suppression. The underlying mechanisms for this activity of plakoglobin are unclear. We previously showed that plakoglobin expression in oral squamous carcinoma cells (SCC9-PG) resulted in a mesenchymal-epidermoid transition, which was concurrent with increased N-cadherin and decreased β-catenin levels. Comparison of the RNA and protein profiles of SCC9 cells and SCC9-PG transfectants identified a number of differentially expressed proteins and transcripts, which suggested that plakoglobin regulates gene expression. Closer analysis of the mRNA profiles of SCC9 and SCC9-PG cells identified several p53 target genes that were differentially expressed upon plakoglobin expression, suggesting that plakoglobin may regulate gene expression in conjunction with p53. Here, we describe the ability of plakoglobin to regulate three potential p53 target genes: the tumor and metastasis suppressors 14-3-3α and Nm23 and the tumor promoter SATB1. We show, by RT-PCR and Western blot, that plakoglobin expression results in increased 14-3-3σ and Nm23 and decreased SATB1 mRNA and protein levels. Co-immunoprecipitation experiments show that plakoglobin and p53 interact, and that these interactions occur in both the cytoplasm and the nucleus. Chromatin immunoprecipitation and Electrophoretic mobility shift assays (EMSA) indicate that plakoglobin and p53 associate with the promoters of these target genes. Finally, luciferase reporter assays confirm that plakoglobin regulates the expression of these p53 target genes. Taken together, the results of these studies provide strong evidence that plakoglobin plays an active role in regulating gene expression, a function that has not often been associated with plakoglobin. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 1185. doi:1538-7445.AM2012-1185

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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