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Enregistrement W2326732642 · doi:10.1021/jz200993d

Mass-Tuned Initial Excited-State Structural Dynamics of DNA Nucleobases from UV Resonance Raman Spectroscopy: 5-Deuterouracil

2011· article· en· W2326732642 sur OpenAlexaff
Susan Ng, Faranak Teimoory, Glen R. Loppnow

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry Letters · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThymineUracilExcited stateNucleobaseChemistrySubstituentPyrimidineResonance (particle physics)Raman spectroscopyResonance Raman spectroscopyPhotochemistryPyrimidine dimerDNAStereochemistryAtomic physicsPhysicsDNA repairOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

5-Deuterouracil (5- d -U) is an analogue of uracil (RNA) and thymine (DNA), which differ only in the mass of their 5-substituent. Previous work has shown that the initial excited-state structural dynamics primarily lie along C5═C6 bond lengthening in thymine, while these dynamics primarily lie along C5 and C6 pyramidalization in uracil. To test whether the 5-substituent mass determines these dynamics, the resonance Raman spectra of 5- d -U, with a 5-substituent mass intermediate between uracil and thymine, is measured at wavelengths throughout its 262 nm absorption band. The resulting spectrum of 5- d -U is intermediate between that of thymine and uracil, indicating both bond-lengthening and pyramidalization motions in the excited state. Self-consistent analysis of the resonance Raman excitation profiles and absorption spectra show that the initial excited-state structural dynamics of 5- d -U are indeed intermediate between those of thymine and uracil, supporting the mass-tuning model of initial excited-state structural dynamics in DNA and RNA pyrimidine nucleobases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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