Novel bacteria associated with Arctic seashore lichens have potential roles in nutrient scavenging
Notice bibliographique
Résumé
While generally described as a bipartite mutualistic association between fungi and algae or cyanobacteria, lichens also host diverse and heretofore little explored communities of nonphototrophic endolichenic bacteria. The composition and possible roles of these bacterial communities in the lichen symbiotic association constitute an emerging field of research. Saxicolous (rock-dwelling) seashore lichens present an unusual environment, characterized by rapid fluctuations in temperature, salinity, exposure to solar radiation, etc. The present study focuses on the bacterial biota associated with 4 species of crustose, halophilic, saxicolous seashore lichens found in northern Iceland. A denaturing gradient gel electrophoresis based characterization of the composition of the lichen-associated microbiotas indicated that they are markedly lichen-species-specific and clearly distinguishable from the environmental microbiota represented by control sampling. A collection of bacterial strains was investigated and partially identified by 16S rDNA sequencing. The strains were found to belong to 7 classes: Alphaproteobacteria, Bacilli, Actinobacteria, Flavobacteria, Cytophagia, Sphingobacteria, and Gammaproteobacteria. Several isolates display only a modest level of similarity to their nearest relatives found in GenBank, suggesting that they comprise previously undescribed taxa. Selected strains were tested for inorganic phosphate solubilization and biodegradation of several biopolymers, such as barley β-glucan, xylan, chitosan, and lignin. The results support a nutrient-scavenging role of the associate microbiota in the seashore lichen symbiotic association.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».