Novel PMMA Polymer-Based Nanopores Capable of Detection and Discrimination Between Structurally Different Biomolecules
Notice bibliographique
Résumé
We report, for the first time, the use of single poly (methyl-methacrylate) (PMMA) polymer-based nanopores to not only detect the translocating biomolecules of dsDNA and BSA in individual populations, but also distinguish between them in a mixed population, based on the obtained depths (iBlock) and durations (tD) of the ionic current blockade events. Quantitative analyzes of current blockade events induced by separate populations of dsDNA and BSA molecules translocating through single PMMA-based nanopores revealed a meaniBlock value of 22.4 ± 0.69 pA with a tDof 0.202 ± 0.009 ms, and a meaniBlock value of 60.14 ± 0.19 pA with a tDof 0.59 ± 0.08 ms for dsDNA and BSA molecules, respectively. Evaluation of translocation events by dsDNA and BSA molecules in a mixed population through single nanopores indicated two distinct groups of current blockade events, extrapolation of which could perfectly correlate the group demonstratingiBlock values of 13-38 pA to the dsDNA molecules, whereas the group demonstratingiBlock values of 52-73 pA to the BSA protein molecules transporting through the nanopores. Analysis of the data suggests that the majority of dsDNA or BSA protein molecules translocating through the nanopores are in their partially folded conformation. This paper is an important milestone in the development of polymer-based solid-state nanopore devices for fast and accurate biomolecule detection, differentiation/discrimination, and future structural characterization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».