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Enregistrement W2327011266 · doi:10.1128/ecosal.5.2.3

Modulation of Chemical Composition and Other Parameters of the Cell at Different Exponential Growth Rates

2008· article· en· W2327011266 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueEcoSal Plus · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRibosomeRNARibosomal RNAExponential growthProtein biosynthesisBiologyMessenger RNACell biologyGrowth rateGeneBiochemistryGene expressionPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This review begins by briefly presenting the history of research on the chemical composition and other parameters of cells of E. coli and S. enterica at different exponential growth rates. Studies have allowed us to determine the in vivo strength of promoters and have allowed us to distinguish between factor-dependent transcriptional control of the promoter and changes in promoter activity due to changes in the concentration of free functional RNA polymerase associated with different growth conditions. The total, or bulk, amounts of RNA and protein are linked to the growth rate, because most bacterial RNA is ribosomal RNA (rRNA). Since ribosomes are required for protein synthesis, their number and their rate of function determine the rate of protein synthesis and cytoplasmic mass accumulation. Many mRNAs made in the presence of amino acids have strong ribosome binding sites whose presence reduces the expression of all other active genes. This implies that there can be profound differences in the spectrum of gene activities in cultures grown in different media that produce the same growth rate. Five classes of growth-related parameters that are generally useful in describing or establishing the macromolecular composition of bacterial cultures are described in detail in this review. A number of equations have been reported that describe the macromolecular composition of an average cell in an exponential culture as a function of the culture doubling time and five additional parameters: the C- and D-periods, protein per origin (PO), ribosome activity, and peptide chain elongation rate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,189

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle