Assembly of DNA-Functionalized Gold Nanoparticles with Gaps and Overhangs in Linker DNA
Notice bibliographique
Résumé
DNA-directed assembly of gold nanoparticles (AuNPs) has been extensively studied because of its important applications in analytical chemistry, materials science, and nanomedicine. In a typical system, two DNA-functionalized AuNPs are assembled via a linker DNA to form large aggregates. In the majority of the previous reports, the linker DNA is fully base paired with no gaps or overhangs present. Introducing such nonbase-paired regions in the linker DNA has been recently shown to be important for making stimuli-responsive materials and in crystallization of such AuNPs. In this work, we systematically studied the effect of introducing gaps and overhangs in the linker DNA to understand the kinetics of assembly and the melting transition of these aggregates. We found that the assembly kinetics decreased with increasing linker DNA length. The melting temperature decreased with the loss of base stacking by introducing gaps as well as the steric effect of overhangs. Additional insights were obtained by measuring the melting curves of the free DNAs in the absence of AuNPs. For example, it appeared that DNA base stacking at the nick site was favored in assembled nanoparticles compared to that in free DNA. Our results indicate that, while it is possible to form AuNP assemblies with linker DNAs containing various types of unpaired regions, these kinetic and thermodynamic factors need to be considered when designing related sensors and materials.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».