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Enregistrement W2327119459 · doi:10.1021/jp111073w

Assembly of DNA-Functionalized Gold Nanoparticles with Gaps and Overhangs in Linker DNA

2011· article· en· W2327119459 sur OpenAlexaff
Brendan D. Smith, Neeshma Dave, Po‐Jung Jimmy Huang, Juewen Liu

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry C · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLinkerColloidal goldStackingDNALinker DNANanomedicineNanoparticleSteric effectsBase pairKineticsNanotechnologyMaterials scienceChemistryCombinatorial chemistryStereochemistryOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA-directed assembly of gold nanoparticles (AuNPs) has been extensively studied because of its important applications in analytical chemistry, materials science, and nanomedicine. In a typical system, two DNA-functionalized AuNPs are assembled via a linker DNA to form large aggregates. In the majority of the previous reports, the linker DNA is fully base paired with no gaps or overhangs present. Introducing such nonbase-paired regions in the linker DNA has been recently shown to be important for making stimuli-responsive materials and in crystallization of such AuNPs. In this work, we systematically studied the effect of introducing gaps and overhangs in the linker DNA to understand the kinetics of assembly and the melting transition of these aggregates. We found that the assembly kinetics decreased with increasing linker DNA length. The melting temperature decreased with the loss of base stacking by introducing gaps as well as the steric effect of overhangs. Additional insights were obtained by measuring the melting curves of the free DNAs in the absence of AuNPs. For example, it appeared that DNA base stacking at the nick site was favored in assembled nanoparticles compared to that in free DNA. Our results indicate that, while it is possible to form AuNP assemblies with linker DNAs containing various types of unpaired regions, these kinetic and thermodynamic factors need to be considered when designing related sensors and materials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,221

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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