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Enregistrement W2327280584 · doi:10.1042/bj20131191

Phosphorylation of bacterial-type phosphoenolpyruvate carboxylase by a Ca2+-dependent protein kinase suggests a link between Ca2+ signalling and anaplerotic pathway control in developing castor oil seeds

2013· article· en· W2327280584 sur OpenAlexaff
Allyson T. Hill, Sheng Ying, William C. Plaxton

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryBiologyPyruvate carboxylasePhosphorylationProtein kinase APhosphoenolpyruvate carboxylasePhosphoenolpyruvate carboxykinaseKinaseGTP'CytosolCalmodulinEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of the present study was to characterize the native protein kinase [BTPC (bacterial-type phosphoenolpyruvate carboxylase)-K (BTPC Ser451 kinase)] that in vivo phosphorylates Ser451 of the BTPC subunits of an unusual Class-2 PEP (phosphoenolpyruvate) carboxylase hetero-octameric complex of developing COS (castor oil seeds). COS BTPC-K was highly purified by PEG fractionation and hydrophobic size-exclusion anion-exchange and affinity chromatographies. BTPC-K phosphorylated BTPC strictly at Ser451 (Km=1.0 μM; pH optimum=7.3), a conserved target residue occurring within an intrinsically disordered region, as well as the protein histone III-S (Km=1.7 μM), but not a COS plant-type PEP carboxylase or sucrose synthase or α-casein. Its activity was Ca2+- (K0.5=2.7 μM) and ATP- (Km=6.6 μM) dependent, and markedly inhibited by trifluoperazine, 3-phosphoglycerate and PEP, but insensitive to calmodulin or 14-3-3 proteins. BTPC-K exhibited a native molecular mass of ~63 kDa and was soluble rather than membrane-bound. Inactivation and reactivation occurred upon BTPC-K's incubation with GSSG and then DTT respectively. Ser451 phosphorylation by BTPC-K inhibited BTPC activity by ~50% when assayed under suboptimal conditions (pH 7.3, 1 mM PEP and 10 mM L-malate). Our collective results indicate a possible link between cytosolic Ca2+ signalling and anaplerotic flux control in developing COS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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