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Enregistrement W2327595442 · doi:10.1093/neuonc/nou260.2

MS-02 * TRANSCRIPTOME ANALYSIS IDENTIFIES THE PI3K/AKT/mTOR PATHWAY AS A TARGETABLE PATHWAY IN SCHWANNOMA

2014· article· en· W2327595442 sur OpenAlexaff
Sameer Agnihotri, K. Burell, Shahrzad Jalali, Amir Alamsahebpour, Nesrin Sabha, Boris Krischek, Kenneth Aldape

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurofibromatosis and Schwannoma Cases
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSchwannomaPI3K/AKT/mTOR pathwayTranscriptomeBiologyCancer researchGene expression profilingMedicineGenePathologyGene expressionSignal transductionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Schwannomas are common benign tumors of the vestibular nerve, or arise from nerves within the spinal canal. Although benign, both Spinal schwannoma (SS) and vestibular schwannoma (VS) cause significant morbidities. The current treatment strategies for VS and SS include surgery or radiation with each treatment option having associated complications and side effects. The transcriptional landscape of schwannoma remains largely unknown. We interrogated the transcriptome by gene-expression array analysis of 49 schwannomas and seven normal control vestibular nerves to identify tumor-specific gene expression patterns. We identified over 4000 differentially expressed genes between control and schwannoma with network analysis uncovering proliferation and anti-apoptotic pathways previously not implicated in VS. Using several distinct clustering technologies, we could not reproducibly identify VS subtypes or significant differences between sporadic and germline NF2 associated schwannomas suggesting that VS comprises of a highly similar entity. We next performed a transcript analysis comparing VS to SS. Surprisingly; we identified few differential transcripts demonstrating that schwannoma maybe a homogenous entity. Current studies are focused on DNA methylation profiling and genome wide sequencing analysis. To date our group and others have identified that inactivating mutations in NF2 is the most recurrent aberration in schwannoma. The most recurrent activated pathway in schwannoma was over-expression of PI3K/AKT/mTOR signaling pathway, which is directly druggable and we evaluated this pathway for therapeutic targeting. Testing compounds BEZ235 and PKI-587, both novel dual inhibitors of PI3K and mTOR, attenuated tumor growth in a cell line model of schwannoma. Our In vitro findings demonstrated that pharmacological inhibition of the PI3K/AKT/mTOR pathway with next generation compounds lead to decreased cell viability, and increased cell death. Future work is testing these compounds in vivo using relevant cell lines and primary cultures of schwannoma. Our findings implicate that targeting the PI3K/AKT/mTOR pathway may serve as a potential treatment strategy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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