Abstract 113: Screening of MicroRNAs Expressed in Isolated Cells of Human Abdominal Aortic Aneurysm for the Identification of Potential Biomarkers
Notice bibliographique
Résumé
Abdominal aortic aneurysm (AAA) is a vascular asymptomatic disease that is one of the leading causes of death in developed countries. Identifying biomarkers for AAA that can be detected easily in blood, before rupture could be useful. The aim of this study was to investigate the potentiality of miRNAS as biomarkers of AAA by performing a profiling of miRNAs expressed in major cells present in the human AAA tissue. The inflammatory cells as macrophages M1 and M2 and smooth muscle cells (SMC) were located by immunohistochemistry in 20 human AAA biopsies, showing a specific distribution towards the aneurysmal aortic wall. The cells were isolated by laser microdissection (LMD) from 20 human AAA biopsies obtained during surgical repair and control SMC from 14 healthy aortic biopsies harvested during organs multiretrieval. RNA extracted from 2 samples of each LMD isolated cells was screened on human miRNAs microarray. MiRNAs were selected with at least a 2-fold change and a detection value threshold corresponding to the value of miR-29b, described in experimental AAA models. Out of the 850 human miRNAs tested for each sample, 408 were found to be present in AAA. Thirty miRNAs were common to each tested cells. Fifty-three miRNAs were found in SMC, of which 12 were specific to AAA compared to control aortas; 86 miRNAs were found in macrophages, of which 11 were specific to M1 macrophages, 37 to M2 macrophages and 38 common to both subtypes. Ten miRNAs were selected to be validated by quantitative RT-PCR in LMD isolated healthy SMC and aneurysmal SMC, M1 and M2 macrophages. We validated 4 miRNAs to be overexpressed in M1 macrophages and 1 overexpressed in M2 macrophages. Two miRs were validated to be less expressed in aneurysmal SMC compared to SMC from normal aortas. MiR-29b expression was specifically down-regulated in aneurysaml SMC compared to normal SMC. In conclusion, the analysis of isolated cells allows to discriminate the miRNAs specifically expressed in inflammatory and vascular cells in AAA and to determine other miRNAs than those described in experimental AAA models as potential biomarkers of AAA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».