The Natural Resistance-Associated Macrophage Protein from the Protozoan Parasite <i>Perkinsus marinus</i> Mediates Iron Uptake
Notice bibliographique
Résumé
Microbial pathogens succeed in acquiring essential metals such as iron and manganese despite their limited availability because of the host's immune response. The eukaryotic natural resistance-associated macrophage proteins mediate uptake of divalent metals and, during infection, may compete directly for metal acquisition with the pathogens' transporters. In this study, we characterize the Nramp gene family of Perkinsus marinus, an intracellular parasite of the eastern oyster, and through yeast complementation, we demonstrate for the first time for a protozoan parasite that Nramp imports environmental Fe. Three PmNramp isogenes differ in their exon-intron structures and encode transcripts that display a trans splicing leader at the 5' end. The protein sequences share conserved properties predicted for the Nramp/Solute carrier 11 (Slc11) family, such as 12-transmembrane segment (TMS) topology (N- and C-termini cytoplasmic) and preferential conservation of four TMS predicted to form a pseudosymmetric proton/metal symport pathway. Yeast fet3fet4 mutant complementation assays showed iron transport activity for PmNramp1 and a fusion chimera of the PmNramp3 hydrophobic core and PmNramp1 N- and C-termini. PmNramp1 site-directed mutagenesis demonstrated that Slc11 invariant and predicted pseudosymmetric motifs (TMS1 Asp-Pro-Gly and TMS6 Met-Pro-His) are key for transport function. PmNramp1 TMS1 mutants D76E, G78A, and D76E/G78A prevented membrane protein expression, while TMS6 M250A, H252Y, and M250A/H252Y specifically abrogated Fe uptake; the TMS6 H252Y mutation also correlates with divergence from Nramp specificity for divalent metals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».