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Enregistrement W2327988935 · doi:10.2174/2211536611201010059

A Macro Role for Imprinted Clusters of MicroRNAs in the Brain

2012· review· en· W2327988935 sur OpenAlexaff
Benjamin I. Laufer, Shiva M. Singh

Notice bibliographique

RevueMicroRNA · 2012
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenomic imprintingBiologyNon-coding RNAmicroRNARNAChromatinGeneticsDNA methylationGeneEpigeneticsNeurogenesisGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Evidence suggests that ~95% of the human genome may produce noncoding RNAs (ncRNAs). Approximately 30% of parentally imprinted transcripts are ncRNAs that are found abundantly--and in some cases specifically--in the brain; however, the role ncRNA plays during development and day-to-day life is not apparent. Interestingly, ~1,300 transcripts show a consistent parental expression bias in the brain. This is in contrast to most tissues that show only rare imprinted transcripts. Furthermore, there are only two clusters of imprinted small nucleolar RNA (snoRNA) encoding genes in mammals, which are also expressed in the brain. These clusters, Snrpn-Ube3a (Human 15q11-q13/Murine 7qC) and Dlk1-Dio3 (Human 14q32.2/Murine 12qF1) and rodent specific Sfmbt2 (Murine 2qA1), form the focus of this review. These imprinted clusters are localized to imprinted regions that are associated with processes involved in neuronal plasticity and several neurodevelopmental disorders. Several miRNAs from the Dlk1-Dio3 region are also involved in chromatin methylation and remodelling. The final loci of interest is the proximal region of murine chromosome 2 that contains Sfmbt2 and an overlapping antisense transcript that is unique within mice and rats. This suggests that Sfmbt2 may be in the process of becoming imprinted that is being driven by a cluster of intergenic miRNAs. Ultimately, imprinted clusters of ncRNA have the potential to offer novel insight into the understanding of the complex processes of cognition given their role in brain function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,957
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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