Soft Adsorption of Densely Packed Layers of DNA-Plasmid·1,3-Diaminopropane Complexes onto Highly Oriented Pyrolitic Graphite Designed To Erode in Water
Notice bibliographique
Résumé
In this Article, we report a simple and effective method to build up self-assembled and well-calibrated layers of plasmid DNA·1,3-diaminopropane complexes onto highly oriented pyrolitic graphite (HOPG). The method is based on the self-assembly of the poly electrolytes onto HOPG in an excess of positively charged protonated diamines (Dap 2+ ) in comparison to the negatively charged phosphate moieties of the DNA backbone in solution. Although short distortions in the helical parameters of DNA (maximum 12% hypochromicity) are revealed by UV–vis absorption spectrometry, the native B form of the plasmids is conserved. By fixing the excess of positive charges arising from Dap 2+ cations, it is possible to construct assemblies of a well-defined thickness ranging typically from 1 monolayer (ML) of DNA to 10 ML; 1 ML has a thickness of 2.2 ± 0.5 nm. Adding TRIS-EDTA (TE) buffer lowers considerably the damage rate observed when plasmids are mixed with Dap 2+ in pure water. The thickness of the first dense monolayer matches well the DNA cross-sectional dimensions, indicating that this layer is strongly anchored to the surface; it is insoluble in water. Conversely, thicker layers can be released in aqueous media, and the plasmids do not undergo dramatic damage. In the presence of TE buffer, condensation of the plasmids on the HOPG surface and a further release of the deposits in water yields a loss of supercoiling that ranges typically from 10% to 20% when the layer thickness varies from 22 to 12 nm. Such densely packed and releasable DNA plasmid layers with a very well-characterized and constant thickness constitute a substantial progress for biochemical and radiochemical experiments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».