Biofilm Formation, Virulence Gene Profiles, and Antimicrobial Resistance of Nine Serogroups of Non-O157 Shiga Toxin–Producing <i>Escherichia coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
The objectives of this study were to characterize the phenotype and genotype of 36 non-O157 Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) strains isolated from humans, ovines, or bovines, including the top 6 (O26, O45, O103, O111, O121, and O145) and three other serogroups implicated in serious illness (O91, O113, and O128). Biofilms were formed by all strains with intermediate to strong biofilm producers (n = 24) more common at 22°C than at 37°C (p < 0.001) and 48 and 72 h (p < 0.001) than 24 h of incubation time. Biofilm-forming potential differed by serogroup and origin with O113 and human strains exhibiting the highest potential (p < 0.001). Biofilm-associated genes, csgA/csgD/crl/fimH (100%), flu (94%), rpoS (92%), ehaA(α) (89%), and cah (72%), were most prevalent, while mlrA (22%) and ehaA(β) (14%) were least prevalent, although there was no clear compliment of genes associated with strains exhibiting the greatest biofilm-forming capacity. Among 12 virulence genes screened, iha and ehxA were present in 92% of the strains. The occurrence of stx1 in the top 6 serogroups (8/12, 67%) did not differ (p = 0.8) from other serogroups (17/24, 71%), but stx2 was less likely (confidence interval [CI] = 0.14-1.12; p = 0.04) to be in the former (9/24, 38%) than the latter (9/12, 75%). Excluding serogroups, O91 and O121, at least one strain per serogroup was resistant to between three and six antimicrobials. Streptomycin (31%), sulfisoxazole (31%), and tetracycline (25%) resistance was most common and was 35-50% less likely (p < 0.05) in human than animal strains. All non-O157 STEC strains were able to form biofilms on an abiotic surface, with some exhibiting resistance to multiple antimicrobials. Potential as a reservoir of antimicrobial resistance genes may be another hazard of biofilms in food-processing plants. As a result, future strategies to control these pathogens may include measures to prevent biofilms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».