Electrospray Ionization Mass Spectrometry Characterization of Interactions of Newly Identified Water Disinfection Byproducts Halobenzoquinones with Oligodeoxynucleotides
Notice bibliographique
Résumé
Four halobenzoquinones, 2,6-dibromo-1,4-benzoquinone, 2,6-dichloro-1,4-benzoquinone, 2,6-dichloro-3-methyl-1,4-benzoquinone, and 2,3,6-trichloro-1,4-benzoquinone, were recently identified as drinking water disinfection byproducts. Understanding their interactions with biomolecules could provide useful insights into their potential toxic effects. We report here electrospray ionization mass spectrometry characterization of the interactions between these new halobenzoquinone disinfection byproducts and oligodeoxynucleotides. The study demonstrates that 2,6-dibromo-1,4-benzoquinone exhibits much stronger binding to single- and double-stranded oligodeoxynucleotides than chlorobenzoquinones. The binding affinity of 2,6-dibromo-1,4-benzoquinone to oligodeoxynucleotides is similar to that of ethidium bromide, a well-known intercalator and carcinogen. Tandem mass spectrometry characterization confirms the formation of 1:1 and 2:1 complexes of 2,6-dibromo-1,4-benzoquinone binding to oligodeoxynucleotides. Collision-induced dissociation analysis of these adducts demonstrates neutral loss and charge separation, suggesting that 2,6-dibromo-1,4-benzoquinone binds to oligodeoxynucleotides through partial intercalation and H-bonding modes. The three chlorobezoquinones also form 1:1 adducts with the oligodeoxynucleotides, but their binding to the oligodeoxynucleotides was much weaker compared to that of 2,6-dibromo-1,4-benzoquinone. The relative binding affinity of the studied disinfection byproducts to oligodeoxynucleotides is in the order of 2,6-dibromo-1,4-benzoquinone≫2,6-dichloro-1,4-benzoquinone > 2,6-dichloro-3-methyl-1,4-benzoquinone ∼ 2,3,6-trichloro-1,4-benzoquinone, indicating potential structural effects on the interactions of halobenzoquinones with oligodeoxynucleotides.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».