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Enregistrement W2328762559 · doi:10.1097/pai.0000000000000305

An Audit of Failed Immunohistochemical Slides in a Clinical Laboratory: The Role of On-Slide Controls

2015· article· en· W2328762559 sur OpenAlex
Carol C. Cheung, Clive R. Taylor, Emina Torlakovic

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineImmunohistochemistryPathologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Appropriate controls are critical for the correct interpretation of immunohistochemistry (IHC) assays and help to detect unsuccessful/suboptimal slides. We performed an audit of slides that were designated as being "failed" by the IHC laboratory (ie, laboratory-failed slides) of a large North American oncology and transplant center. All slides were run with on-slide controls. The study included analysis of only those failed slides where staining of both internal and external controls were unsuccessful/suboptimal in a period of 65 days. Failed slides were categorized based on the reason why the laboratory failed the slides. The study compared frequencies of failed slides across 9 automated stainers from 2 manufacturers and between class 1 and class 2 biomarkers. Distinction between "failed slides" and "false-negative/false-positive tests" is emphasized. The study included 22,234 IHC slides in the study period. Of those, 452 (2%) were designated as "failed" by the laboratory. Class 1 and class 2 tests showed failure rates of 0.8% and 9%, respectively. The most frequent reason for failed slides on one platform related to "no or weak staining," whereas the other had more failed slides due to "high signal-to-noise ratio" (P<0.0001, χ test). Although the slides were run in groups of the same as well as different IHC protocols, unsuccessful/suboptimal testing typically manifested as individual slides (92%) and not as groups of slides; this indicates that so-called "batch controls" are not suitable as controls for automated platforms. We conclude that in the era of automated IHC staining platforms, on-slide controls allow for the proper identification of IHC slides that should be failed by the IHC laboratory and represent a powerful tool for preventing the reporting of false-negative/false-positive tests.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle