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Enregistrement W2328902541 · doi:10.1016/j.biopen.2016.01.001

Assessing Na+/H+ exchange and cell effector functionality in metastatic breast cancer

2016· review· en· W2328902541 sur OpenAlexafffund
Schammim Ray Amith, Jodi Marie Wilkinson, Larry Fliegel

Notice bibliographique

RevueBiochimie Open · 2016
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchWomen and Children's Health Research InstituteChildren's Health Research Institute
Mots-clésMetastasisMetastatic breast cancerCancer cellExtracellularCancerEffectorIntracellularCancer researchExtracellular matrixCell cultureChemistryCell migrationCellBreast cancerCell biologyBiologyMedicineInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metastasis is the leading cause of mortality in patients with breast cancer. In triple-negative breast cancer, high recurrence rates, increased invasive capacity of cells, and their aggressive ability to metastasize at secondary sites dictate patient survival. The Na+/H+ exchanger isoform 1 (NHE1) plays a critical role in controlling the metastatic potential of these cells. Its activity results in an elevation of intracellular pH and in extracellular acidification, a key step in the establishment of the tumor microenvironment. Here, we describe assays for characterization of Na+/H+ exchanger activity and its related downstream physiological effects on triple-negative breast cancer cells. Na+/H+ exchanger activity can be routinely and rapidly measured in live cells with a fluorometric assay that assesses changes in intracellular pH. Characterization of downstream cell effector function as a result of Na+/H+ exchanger activation can be evaluated by measuring directed cell migration and invasion. Cell migration is assessed with wound-healing assays, where a gap is introduced in a confluent monolayer of cells and the rate of gap closure is measured over time. Cell invasion is assessed in the short-term by transwell invasion assays that track cell movement through an extracellular matrix. Long-term invasiveness, growth and proliferation can be assessed with 3-D invasion assays using transwell inserts fitted with specialized scaffolds optimized for 3-D cell culture. Taken together these assays provide powerful tools for testing the effects of altering Na+/H+ exchanger activity with chemical inhibition on the metastatic capacity of breast cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,990
Score d'incertitude au seuil0,866

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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