MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2328918404 · doi:10.1158/1538-7445.am2012-30

Abstract 30: The integrin α6A splice variant regulates colon cancer cell proliferation and the Wnt/β-catenin pathway

2012· article· en· W2328918404 sur OpenAlexaff
Jean‐François Groulx, Véronique Giroux, Nùria Basora, Elizabeth Herring, Julie Carrier, Jean‐François Beaulieu

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayGene knockdownIntegrinColorectal cancerCancer researchCancerBiologyCateninCell growthPopulationAlternative splicingCancer cellCell cultureCellCell biologyGene isoformMedicineSignal transductionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Colon cancer is a major cause of death by cancer in North America. Recently, we found that both subunits of the integrin α6β4 are up-regulated in colon primary tumours. The α6 integrin subunit exists as two distinct splice isoforms, α6A and α6B. It is the α6A isoform that was shown to be associated with the proliferative cell population of the normal human colon and up-regulated in colorectal cancer. The aim of this study was to analyze the role of integrin α6Aβ4 in human colon cancer, more precisely its effect on cell proliferation and its mechanism of regulation. To investigate the function of integrin α6Aβ4 in colon cancer, expression of splice variant α6A was specifically abolished, using shRNA technology, in colon adenocarcinoma cell lines (Caco-2/15, T84, SW480, SW620, DLD-1 and HT29). The function of splice variant α6A of the α6β4 integrin was investigated in vitro and in tumour xenografts. In all colon cancer cell lines tested, knockdown of the integrin α6A subunit resulted in a decrease of up to 90% of the α6A variant without affecting the levels of the α6B variant. Furthermore, no compensatory expression of α6Bβ4 integrin was observed following the abolition of the α6A subunit. In the majority of colon cancer cell lines, the knockdown of α6A resulted in a significant decrease in proliferation as show by BrdU incorporation. Moreover, it was accompanied by reduced activity of the Wnt/β-catenin pathway as measured by a decrease of responsive β-catenin/TCF promoter activity and increased β-catenin phosphorylation at Ser37/Thr41 by GSK3β. Preliminary data confirmed that in these cells, the Wnt/β-catenin pathway can be stimulated by pharmacological inhibition of GSK3β (SB216763), as displayed by a decrease of β-catenin phosphorylation at Ser37/Thr41 and an increase in responsive β-catenin/TCF promoter activity. Analysis of splice variants of the α6 integrin subunit in human colorectal cancer revealed that α6A was increased in 80% of tumours as compared to their matched resection margins and a significant correlation was observed between expression of α6A and c-myc in the tumours. Furthermore, to determine the role of the integrin α6A subunit on colon cancer tumorigenesis in vivo, control and α6A knockdown T84, SW620, HT29 and DLD-1 cells were injected into nude mice. Results showed that abolition of the integrin α6A subunit led to a significant reduction in tumour growth for T84, SW620 and HT29 colon cell lines. Moreover, analysis of tumours showed an increase in β-catenin phosphorylation at Ser37/Thr41 in T84 and HT29. Our results show for the first time that splice variant A of the integrin α6 subunit regulates the Wnt/β-catenin pathway to promote cancer cell growth. Since 80% of colon cancers display an up-regulation of integrin α6A expression, targeting this integrin in colon cancers may offer new therapeutic value. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 30. doi:1538-7445.AM2012-30

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetCell Adhesion Molecules Research→Travaux en français237 207→