Influence of polymorphisms within the CX3CR1 and MDR-1 genes on initial antiretroviral therapy response
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Single nucleotide polymorphisms (SNP) in the genes encoding the human CX3CR1 chemokine receptor and the P-glycoprotein multidrug transporter have been associated with accelerated disease progression in untreated individuals and implicated in therapeutic response, respectively. This retrospective study assessed the influence of SNP in the CX3CR1 and MDR-1 genes on initial virological and immunological response in 461 HIV-infected, antiretroviral-naive individuals initiating antiretroviral therapy in British Columbia, Canada. METHODS: CX3CR1 and MDR-1 SNP were determined by PCR amplification of human DNA from plasma, followed by DNA sequencing. Time to virological success [time to HIV plasma viral load (pVL) < or = 500 copies/ml], virological failure (subsequent time to the second of two consecutive pVL > or = 500) and immunological failure (time to the second consecutive CD4 cell count below baseline) were analyzed by Kaplan-Meier methods. RESULTS: Frequencies of CX3CR1 amino acid haplotypes were 249V 280T (0.75), 249I 280M (0.15), and 249I 280T (0.1). Frequencies of MDR-1 nucleotide polymorphisms were 3435C (0.47) and 3435T (0.53). There was no effect detected for SNP in CX3CR1 or MDR-1 on time to virological success, nor of CX3CR1 and MDR-1 SNP on time to virological and immunological failure, respectively ( P > 0.1). There was a trend to earlier virological failure in the MDR-1 3435C/C genotype group ( P = 0.07), and a statistically significant trend to earlier immunological failure in individuals with the CX3CR1 249I polymorphism ( P = 0.02). These remained significant after correcting for baseline age, sex, pVL, CD4 cell count, type of therapy, and adherence ( P < or = 0.05). CONCLUSION: Polymorphisms in MDR-1 and CX3CR1 may be associated with accelerated virological and immunological therapy failure, respectively.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».