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Enregistrement W2329291046 · doi:10.1158/1538-7445.am10-1869

Abstract 1869: Genetic variants of DNA repair genes and lung cancer among nonsmokers: A pooled analysis in the International Lung Cancer Consortium

2010· article· en· W2329291046 sur OpenAlexaff
Yuan‐Chin Amy Lee, Paolo Boffetta, Paul Brennan, David C. Christiani, Chikako Kiyohara, Qing Lan, Adeline Seow, Paolo Vineis, Zuo‐Feng Zhang

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLung cancerMedicineSingle-nucleotide polymorphismOdds ratioGenotypingInternal medicineCancerOncologyLogistic regressionConfidence intervalEpidemiologyGenotypeGeneticsGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Lung cancer among nonsmokers has been considered as a different disease from that among smokers. Involuntary smoking has been suggested to be a risk factor for lung cancer among nonsmokers with a modest effect. Few studies have examined the role of single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the DNA repair genes and their potential interactions with involuntary smoking on the development of lung cancer among nonsmokers. Methods We evaluated the associations between SNPs of the DNA repair genes and lung cancer based on a pooled data of the International Lung Cancer Consortium. The individual-level epidemiological data and genotyping data on eight SNPs from six participating studies were pooled, including 845 nonsmoker cases and 4,262 nonsmoker controls. Logistic regression models with adjustment by age, sex, ethnicity, study, and ever involuntary smoking status were used to obtain odds ratios (OR) and 95% confidence intervals (CI). Results Among nonsmokers, the associations with the polymorphisms in OGG1 S326C and XPD D312N were observed among those with involuntary smoking (for OGG1 S326C: OR=1.61, 95% CI 1.18-2.20 for CG, OR=1.74, 0.99-3.06 for GG, compared to CC; for XPD D312N: OR=1.06, 0.76-1.47 for AG, OR=1.60, 1.06-2.42 for AA, compared to GG), but not for those without involuntary smoking (for OGG1 S326C: OR=0.78, 0.39-1.54 for CG, OR=0.88, 0.25-3.06 for GG, compared to CC; for XPD D312N: OR=1.13, 0.57-2.21 for AG, OR=0.81, 0.27-2.43 for AA, compared to GG). The association with XRCC3 T241M variant was detected for adenocarcinoma and non-small cell lung cancer among those without exposure to involuntary smoking (adenocarcinoma: OR=3.52, 1.21-10.20 for AA, OR=0.94, 0.38-2.38 for GA, compared to GG; and non-small cell lung cancer: OR=2.75, 1.05-7.21 for AA, OR=1.10, 0.51-2.38 for GA, compared to GG, respectively). Due to limited power, no apparent interaction between DNA repair SNPs and involuntary smoking was detected. Conclusion This is the first large-scale collaborative study on the relationship between DNA repair genetic variants and lung cancer among nonsmokers, accounting for involuntary smoking. Our results show that SNPs of the DNA repair genes may play an important role for lung cancer among nonsmokers, and the associations may vary by involuntary smoking status and histological subtype. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 1869.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,082

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,014
Bibliométrie0,0050,008
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
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