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Enregistrement W2329400552 · doi:10.1128/jvi.03115-15

Nuclear Translocation Sequence and Region in Autographa californica Multiple Nucleopolyhedrovirus ME53 That Are Important for Optimal Baculovirus Production

2016· article· en· W2329400552 sur OpenAlexafffund
Yang Liu, Jondavid de Jong, Éva Nagy, David A. Theilmann, Peter J. Krell

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésAutographa californicaBiologyVirologyVirusNuclear localization sequenceRecombinant virusBaculoviridaePeptide sequenceNuclear Polyhedrosis VirusSignal peptideNuclear transportViral envelopeHemagglutinin (influenza)CytoplasmRecombinant DNAGeneMolecular biologyCell nucleusCell biologyGeneticsSpodoptera

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: Autographa californicamultiple nucleopolyhedrovirus (AcMNPV) is in the familyBaculoviridae, genusAlphabaculovirus AcMNPVme53is a highly conserved immediate early gene in all lepidopteran baculoviruses that have been sequenced and is transcribed up to late times postinfection. Althoughme53is not essential for viral DNA synthesis, infectious budded virus (BV) production is greatly attenuated when it is deleted. ME53 associates with the nucleocapsid on both budded virus and occlusion-derived virus, but not with the virus envelope. ME53 colocalizes in plasma membrane foci with the envelope glycoprotein GP64 in a GP64-dependent manner. ME53 localizes in the cytoplasm early postinfection, and despite the lack of a reported nuclear localization signal (NLS), ME53 translocates to the nucleus at late times postinfection. To map determinants of ME53 that facilitate its nuclear translocation, recombinant AcMNPV bacmids containing a series of ME53 truncations, internal deletions, and peptides fused with hemagglutinin (HA) or green fluorescent protein (GFP) tags were constructed. Intracellular-localization studies identified residues within amino acids 109 to 137 at the N terminus of ME53 that acted as the nuclear translocation sequence (NTS), facilitating its nuclear transport at late times postinfection. The first 100 N-terminal amino acids and the last 50 C-terminal amino acids of ME53 are dispensable for high levels of budded virus production. The region within amino acids 101 to 398, which also contains the NTS, is critical for optimal levels of budded virus production. IMPORTANCE: Baculovirusme53is a conserved immediate early gene found in all sequenced lepidopteran alpha- and betabaculoviruses. We first identified residues within amino acids 109 to 137 at the N terminus that act as the ME53 nuclear translocation sequence (NTS) to facilitate its nuclear translocation and defined an internal region within amino acids 101 to 398, which includes the NTS, as being necessary for optimal budded virus production. Altogether, these results indicate a previously unidentified nuclear role that ME53 plays in virus replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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