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Enregistrement W2329477774 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-lb-332

Abstract LB-332: High-throughput proteomic analysis identifies protein S as a potential modulator of androgen-independent prostate cancer

2011· article· en· W2329477774 sur OpenAlexaff
Punit Saraon, Keith Jarvi, Eleftherios P. Diamandis

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBiomarkers in Disease Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLNCaPProstate cancerAndrogenCancer researchAndrogen receptorBiologyAndrogen deprivation therapyProstateCancerInternal medicineEndocrinologyMedicineHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Prostate cancer is the most commonly diagnosed and second leading cause of death due to cancer in men. Androgen deprivation remains the mainstay therapy, which is efficient in shrinking androgen-dependent tumors. However, many men eventually stop responding to this treatment, progressing to a more lethal androgen-independent prostate cancer. The mechanisms mediating these transitions remain unknown, and as a result, there are no effective treatments. We hypothesize the presence of specific modulators, important for the progression to androgen-independency. To test this, we performed high-throughput proteomic analysis on the conditioned media of the androgen-dependent cell lines LNCaP and VCaP, androgen-independent cell lines LNCaP-SF, DU-145, PC3, PPC1, 22Rv1, as well as a normal prostate cell line (RWPE). This allowed us to compile a comprehensive data set, permitting us to mine for differentially secreted proteins that could serve as potential markers for androgen-independent cancers. We utilized quantitative real-time PCR, as well as in vitro wound healing assays to corroborate our proteomic analysis results. We were able to identify the anti-coagulant factor, Protein S (PROS1), as a potential modulator and marker of androgen-independence. Based on spectral counts, PROS1 was found highly secreted in all the androgen-independent cell lines, with no detectable secretion in the normal or androgen-dependent cell lines. The gene expression profile of the androgen-independent cell lines also maintained the over-expression of PROS1, when compared to the normal and androgen-dependent cell lines, while only prostate cancer tissue samples showed an upregulation of PROS1. Furthermore, recombinant PROS1-treated LNCaP cells demonstrated an increase in wound repair and invasive growth potential, implying that PROS1 may have functional roles outside of the coagulation pathway. Our results suggest that PROS1 is involved in the progression of androgen-independent prostate cancers. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr LB-332. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-LB-332

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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