Detection of viable but nonculturable <i>Escherichia coli</i> O157:H7 using propidium monoazide treatments and qPCR
Notice bibliographique
Résumé
Escherichia coli O157:H7 can enter into a viable but nonculturable (VBNC) state under stress conditions. The aims of the present study were to examine the influences of environmental factors on the survivability and culturability of E. coli O157:H7 and to develop an approach for accurate detection of VBNC E. coli O157:H7. The E. coli O157:H7 strain ATCC 6589 was inoculated into 3 induction microcosm models: (i) Luria-Bertani broth, (ii) sterilized tap water, and (iii) sterilized physiological saline solution. Our results showed that low temperature and nutritional starvation significantly impacted on the survivability of E. coli O157:H7 cells and that the in-vitro-induced VBNC cells were capable of resuscitating under normal temperature and appropriate nutrients. We tested the effectiveness of an approach combining propidium monoazide (PMA) treatment with real-time polymerase chain reaction (PMA-qPCR) for accurate quantification of total, viable, dead, and VBNC cells under different induction microcosm models. Our results indicated different threshold cycle (Ct) values for PMA-treated cells and untreated cells (ΔCt = 4.97, 4.29, and 3.30 for Luria-Bertani broth, sterilized tap water, and sterilized physiological saline solution, respectively). We determined the quantification limit of this PMA-qPCR approach to be 1 × 10(2) cells·mL(-1), providing sufficient sensitivity for detection of VBNC E. coli O157:H7 cells to no less than 100 cells·mL(-1). This study clearly demonstrated the feasibility and effectiveness of using PMA-qPCR to accurately quantify E. coli O157:H7 in a VBNC state.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».