Dissipative Particle Dynamics with an Effective Pair Potential from Integral Equation Theory of Molecular Liquids
Notice bibliographique
Résumé
We present a method of DPD simulation based on a coarse-grained effective pair potential obtained from the DRISM-KH molecular theory of solvation. The theory is first used to calculate the radial distribution functions of all-atom solute monomers in all-atom solvent and then to invert them into an effective pair potential between coarse-grained beads such that their fluid without solvent accounts for molecular specificities and solvation effects in the all-atom system. Bonded interactions are sampled in relatively short MD of the all-atom system and modeled with best multi-Gaussian fit. Replacing the heuristically defined conservative force potential in DPD, the coarse-grained effective pair potential is free from the artificial restrictions on potential range and shape and on equal volume of solute and solvent blobs inherent in standard DPD. The procedure is flexible in specifying coarse-grained mapping and enormously increases computational efficiency by eliminating solvent. The method is validated on polystyrene chains of various length in toluene at finite concentrations for room and polystyrene glass transition temperature. It yields the chain elastic properties and diffusion coefficient in good agreement with experiment and all-atom MD simulations. DPD with coarse-grained effective pair potential is capable of predicting both structural and dynamic properties of polymer solutions and soft matter with high accuracy and computational efficiency.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».