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Enregistrement W2329581929 · doi:10.4238/2014.january.31.5

Specific BRCA1 gene variations amongst young Moroccan breast cancer patients

2014· article· en· W2329581929 sur OpenAlexaff
Amal Tazzite, S. Nadiffi, Denise Kottwitz, M. Amrani, H. Jouhadi, A. Benider, Abdeladim Moumen, Hassan Sefrioui

Notice bibliographique

RevueGenetics and Molecular Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensResponse Biomedical (Canada)
Organismes subventionnairesSt. George's, University of London
Mots-clésExonBreast cancerMutationGeneticsGermline mutationBiologyPopulationSilent mutationGene mutationGeneCancer researchCancerMedicineMissense mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germline mutations in the BRCA1 gene are known predictive markers for the development of hereditary breast cancer. Nevertheless, no comprehensive study has been performed targeting the presence and relevance of BRCA1 mutations in Moroccan breast cancer patients. We here present an analysis of BRCA1 gene regions (exon 2 and exon 11a/b) of 50 female Moroccan breast cancer patients with early disease onset (≤ 40 years) or familial disease backgrounds. Results showed that no mutation was present in either exon 2 or exon 11a of the BRCA1 gene in any of the 50 patients analysed. However, in exon 11b, a mutation generated by a nucleotide exchange was detected in 8% of patients, most of whom were young women (≤ 40). This mutation leads to substitution of the amino acid glutamine by an arginine at position 356 of the polypeptide sequence (Q356R). Although this mutation was previously characterised at a lower frequency in western populations, our study is the first to describe it in a young Moroccan population. Furthermore, another mutation was detected with a high frequency (4%) on exon 11b of the BRCA1 gene in exclusively young patients (≤ 40). This mutation was silent, encoding the same threonine residue at position 327 (T327T) as the wild type. The present study is the first to describe this mutation as well, particularly in a young Moroccan population. Analysis of a larger population is required in order to highlight the relevance of the Q356R and T327T mutations in young Moroccan breast cancer patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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