Distance Measurements within a Concatamer of the Plasma Membrane Cl<sup>−</sup>/HCO<sub>3</sub><sup>−</sup> Exchanger, AE1
Notice bibliographique
Résumé
AE1, which exists in the erythrocyte plasma membrane as a noncovalent dimer, facilitates transmembrane Cl⁻/HCO₃⁻ exchange. Here a concatamer of AE1 (two AE1 monomers fused via a two-residue linker to form an intramolecular dimer) was designed to facilitate fluorescence resonance energy transfer (FRET) studies. The concatameric protein (AE1·AE1) was expressed at the plasma membrane at levels similar to that of wild-type AE1 and had Cl⁻/HCO₃⁻ exchange activity indistinguishable from that of wild-type AE1. Nondenaturing gel electrophoresis revealed that AE1·AE1 does not associate into higher-order oligomers when expressed in HEK293 cells and Xenopus laevis oocytes. The cysteine-less concatamer (AE1·AE1-C⁻) enabled introduction of unique cysteine residues into the whole intramolecular dimer. AE1(Q434C)·AE1(Q434C)-C⁻, with a single cysteine residue in each AE1 subunit, was labeled with the donor Alexa Fluor 488 C(5)-maleimide (AF) and the acceptor tetramethylrhodamine methanethiosulfonate (TMR-MTS). Energy transfer efficiency revealed that the distance between these residues in the AE1 dimer is 49 ± 5 Å. The 72% FRET efficiency observed between AE1(Q434C)·AE1-C⁻ labeled with AF and the lipid bilayer labeled with 1,1'-didodecyl-3,3,3',3'-tetramethylindocarbocyanine perchlorate indicates that Q434 is less than 33 Å from the lipid bilayer. We thus provide two distance constraints for the position of Q434, which is located in extracellular loop 1, connecting the first two transmembrane segments of AE1.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».