A genetic map of an Australian wild<i>Gossypium</i>C genome and assignment of homoeologies with tetraploid cultivated cotton
Notice bibliographique
Résumé
Genetic diversity for traits such as fibre quality or disease resistance to microorganisms is limited in the elite cotton germplasm; consequently, cotton breeders are looking for novel alleles in the secondary or even in the tertiary gene pools. The wild Australian Gossypium species (tertiary gene pool) represent an alternative source of novel alleles. However, to use these species efficiently, enabling tools are required. Chromosome-specific molecular markers are particularly useful tools to track the transmission of this exotic genetic material into the cultivated cotton during introgression. In this study, we report the construction of a genetic linkage map of the Australian wild C-genome species Gossypium sturtianum. The map, based on an F(2) population of 114 individuals, contains 291 AFLP loci. The map spans 1697 cM with an average distance of 5.8 cM between markers. To associate C-genome chromosomes with the A and D subgenomes of cultivated cotton, 29 SSR and RFLP-STS markers were assigned to chromosomes using cultivated cotton mapped marker information. Polymorphisms were revealed by 51 AFLP primer combinations and 38 RFLP-STS and 115 SSR cotton mapped markers. The utility of transferring RFLP-STS and SSR cotton mapped markers to other Gossypium species shows the usefulness of a comparative approach as a source of markers and for aligning the genetic map of G. sturtianum with the cultivated species in the future. This also indicates that the overall structure of the G. sturtianum linkage groups is similar to that of the A and D subgenomes of cotton at the gross structural level. Applications of the map for the Australia wild C-genome species and cotton breeding are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».