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Enregistrement W2329736732 · doi:10.1139/g11-037

A genetic map of an Australian wild<i>Gossypium</i>C genome and assignment of homoeologies with tetraploid cultivated cotton

2011· article· en· W2329736732 sur OpenAlex
Luís Augusto Becerra López‐Lavalle, B. Matheson, Curt L. Brubaker

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenome · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueResearch in Cotton Cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAnhui University of Science and Technology
Mots-clésBiologyGossypiumIntrogressionGermplasmAmplified fragment length polymorphismGeneticsRestriction fragment length polymorphismGenomeGenetic diversityGenetic linkageGenetic markerPlant geneticsGene mappingPopulationGossypium barbadenseMolecular breedingChromosomeGeneBotanyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic diversity for traits such as fibre quality or disease resistance to microorganisms is limited in the elite cotton germplasm; consequently, cotton breeders are looking for novel alleles in the secondary or even in the tertiary gene pools. The wild Australian Gossypium species (tertiary gene pool) represent an alternative source of novel alleles. However, to use these species efficiently, enabling tools are required. Chromosome-specific molecular markers are particularly useful tools to track the transmission of this exotic genetic material into the cultivated cotton during introgression. In this study, we report the construction of a genetic linkage map of the Australian wild C-genome species Gossypium sturtianum. The map, based on an F(2) population of 114 individuals, contains 291 AFLP loci. The map spans 1697 cM with an average distance of 5.8 cM between markers. To associate C-genome chromosomes with the A and D subgenomes of cultivated cotton, 29 SSR and RFLP-STS markers were assigned to chromosomes using cultivated cotton mapped marker information. Polymorphisms were revealed by 51 AFLP primer combinations and 38 RFLP-STS and 115 SSR cotton mapped markers. The utility of transferring RFLP-STS and SSR cotton mapped markers to other Gossypium species shows the usefulness of a comparative approach as a source of markers and for aligning the genetic map of G. sturtianum with the cultivated species in the future. This also indicates that the overall structure of the G. sturtianum linkage groups is similar to that of the A and D subgenomes of cotton at the gross structural level. Applications of the map for the Australia wild C-genome species and cotton breeding are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,887
Score d'incertitude au seuil0,400

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle