Fluorescence Resonance Energy Transfer in Partially and Fully Labeled Pyrene Dendronized Porphyrins Studied with Model Free Analysis
Notice bibliographique
Résumé
A series of dendronized porphyrins were synthesized and their photophysical properties were determined by UV–vis absorption, steady-state fluorescence, and time-resolved fluorescence. The constructs contained a porphyrin core connected to a first generation Fréchet-type dendron (Py 2 G1) with or without a C 4 -butanoate linker, and to a second generation dendron (Py 4 G2) with a C 4 -linker. Pyrene and porphyrin were selected as donor and acceptor, respectively, for fluorescence resonance energy transfer or FRET. FRET occurred efficiently within the dendronized porphyrins as determined from the extremely weak fluorescence of pyrene. The number of pyrene groups present in the constructs was varied from two to eight, but was found to have little effect on FRET as FRET took place efficiently from an excited pyrene to a ground-state porphyrin. The parameter that was found to affect FRET the most was the distance separating pyrene from porphyrin within a construct. This effect was probed successfully by fitting the pyrene and porphyrin fluorescence decays according to the model free analysis (MFA) which yielded the average rate constant ⟨ k ET ⟩ for FRET. ⟨ k ET ⟩ increased continuously with decreasing distance separating porphyrin and pyrene as determined by conducting molecular mechanics optimizations on the constructs. The ⟨ k ET ⟩ values were used to determine the through-space distance d Por–Py TS separating porphyrin from pyrene. d Por–Py TS was found to scale as ( d Por–Py EXT ) 0.5, where d Por–Py EXT represents the distance separating porphyrin and pyrene when the construct adopts its most extended conformation. This relationship suggests that FRET occurs intramolecularly inside the constructs between pyrene and porphyrin where both dyes are linked by a string of freely jointed Kuhn segments of length l K = 9 Å.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».