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Enregistrement W2330159253 · doi:10.1152/ajpcell.00294.2001

Coregulation of fast contractile protein transgene and glycolytic enzyme expression in mouse skeletal muscle

2002· article· en· W2330159253 sur OpenAlexaff
Patricia L. Hallauer, Kenneth E.M. Hastings

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTransgeneGlycolysisSkeletal muscleGenetically modified mouseGene expressionGene isoformRegulation of gene expressionEnhancerCell biologyBiochemistryMolecular biologyGeneEnzymeEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Little is known of the gene regulatory mechanisms that coordinate the contractile and metabolic specializations of skeletal muscle fibers. Here we report a novel connection between fast isoform contractile protein transgene and glycolytic enzyme expression. In quantitative histochemical studies of transgenic mouse muscle fibers, we found extensive coregulation of the glycolytic enzyme glycerol-3-phosphate dehydrogenase (GPDH) and transgene constructs based on the fast skeletal muscle troponin I (TnIfast) gene. In addition to a common IIB > IIX > IIA fiber type pattern, TnIfast transgenes and GPDH showed correlated fiber-to-fiber variation within each fast fiber type, concerted emergence of high-level expression during early postnatal muscle maturation, and parallel responses to muscle under- or overloading. Regulatory information for GPDH-coregulated expression is carried by the TnIfast first-intron enhancer (IRE). These results identify an unexpected contractile/metabolic gene regulatory link that is amenable to further molecular characterization. They also raise the possibility that the equal expression in all fast fiber types observed for the endogenous TnIfast gene may be driven by different metabolically coordinated mechanisms in glycolytic (IIB) vs. oxidative (IIA) fast fibers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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