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Enregistrement W2330227029 · doi:10.1107/s0108767308089009

Design of anti-allergic inhibitors for human hematopoietic prostaglandin D synthase

2008· article· en· W2330227029 sur OpenAlexaff
Hiroe Kikuchi, Yuji Kado, Hideaki Matsumura, Yoshifumi Fukunishi, Toshihiko Kinoshita, Yoshitoshi Okuno, Isao Nakanishi, Seiji Minakata, Takeshi Sakata, Kosuke Aritake, Y. Urade, Takanobu Inoue

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations of Crystallography · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensSystems, Applications & Products in Data Processing (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésATP synthaseHaematopoiesisProstaglandinPharmacologyMedicineChemistryImmunologyEnzymeBiologyBiochemistryCell biologyStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Choline kinase (ChoK) catalyzes the ATP-dependent phosphorylation of choline, the first committed step in the CDP-choline pathway for the biosynthesis of phosphatidylcholine.Overexpression and increased activity of one of the human ChoK isoforms, ChoK alpha have been constitutively reported in malignant cells and tumour tissues.This suggests that the enzyme plays a relevant role in tumorigenesis.Some sets of in vitro and in vivo experiments confirmed that ChoK inhibition is one of the potential novel strateges for the development of new antiproliferative and anticancer drugs.The importance of ChoK for the regulation of cell proliferation has been studied by using an inhibitor hemicholinium-3 (HC-3), which was initially characterized as a lethal, respiratory paralytic agent.Most of the ChoK inhibitors introduced so far are the chemically modified derivatives based on the structure of HC-3.Crystal structures of HC-3 bound human ChoK alpha were determinded with and without ADP.In the crystal structures, HC-3 molecule was well accommodated between the N and C-terminal lobes of ChoK protein, and its one end was placed on the same binding site as a substrate choline, while the other end partially exposed to the solvent.The inhibitor molecule was stabilized mainly through the hydrophobic interactions contributed by the C-terminal lobe.These 3D information provides the first molecular detailed view concerning the mode of inhibitory action and expand our understanding of the factors governing selectivity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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