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Enregistrement W2330467586 · doi:10.1093/toxsci/kfv069

Proteomic Analysis of Cerebellum in Common Marmoset Exposed to Methylmercury

2015· article· en· W2330467586 sur OpenAlexaff
Yueting Shao, Megumi Yamamoto, Daniel Figeys, Zhibin Ning, Hing Man Chan

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMercury impact and mitigation studies
Établissements canadiensUniversity of OttawaOntario GenomicsUniversity of Northern British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMarmosetCerebellumChemistryNeurotoxicityNeurotransmissionCalciumBiochemistryBiologyNeuroscienceToxicityReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cerebellum is known as the major target regions of methylmercury (MeHg) toxicity, but the mechanisms are still not fully understood. We studied the effects of MeHg exposure in the cerebellum of common marmoset (Callithrix jacchus) using a shotgun proteomic approach with liquid chromatography coupled to mass spectrometry. A total of 1000 common proteins were identified in all samples, and 102 proteins were significantly differentially expressed in the cerebellum of common marmoset with orally dosed MeHg (1.5 mg MeHg/kg body weight for 2 weeks) compared with those of the control group. Functional enrichment analysis and pathway predictions showed that the differentially expressed proteins were involved in carbohydrate derivative metabolic process, ion transport including synaptic transmission, cell development, and calcium signaling pathway. Cellular component enrichment analysis showed that they were mainly distributed in plasma membrane, excitatory synapse, and synaptic membrane. These results indicate that synaptic transmission and calcium signaling pathways are the core functions affected by MeHg. We found a total of 21 novel proteins affected by MeHg in synaptic transmission and calcium signaling pathways. DLG4: (PSD95) and MIR-19A/MIR-19B were found to be potential key targets leading to the multiple effects of MeHg neurotoxicity. These results show the global effects of MeHg on cellular functions and pathways leading to neurological deficits in common marmoset.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,109
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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